1、问答题  TrEMBL哪两个部分？

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本题答案：（1）SP-TrEMBL（SWISS-PROTTrEM
本题解析：试题答案（1）SP-TrEMBL（SWISS-PROTTrEMBL）
包含最终将要集成到SWISS-PROT的数据，所有的SP-TrEMBL序列都已被赋予SWISS-PROT的登录号。
（2）REM-TrEMBL（REMainingTrEMBL）
包括所有不准备放入SWISS-PROT的数据，因此这部分数据都没有登录号。

2、填空题  提供蛋白质功能注释信息的数据库：（）（京都基因和基因组百科全书）和（）（蛋白质信息资源）

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本题答案：KEGG；PIR
本题解析：试题答案KEGG；PIR

3、名词解释  折叠识别法

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本题答案：寻找与已知蛋白最合适的模板，进行结构和序列比对，最终建
本题解析：试题答案寻找与已知蛋白最合适的模板，进行结构和序列比对，最终建立机构模型。
又称为线索化方法。（另一版本：先假设一个特定的蛋白构象，然后对这一构象进行评估的过程。）

4、问答题  在基因组序列分析方面，科学家关注哪些信息？

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来源:91题 库 网 本题答案：就人类基因组而言，编码区域在人类基因组所占的比例不超过
本题解析：试题答案就人类基因组而言，编码区域在人类基因组所占的比例不超过3%。其余97%是非编码序列。对于非编码序列，人们了解得比较少，尚不清楚其含义或功能。然而，非编码区域对于生命活动具有重要的意义。这部分序列主要包括内含子、简单重复序列、移动元件（mobileelement）及其遗留物、伪基因（pseudogene）等。

5、填空题  初级序列数据库（）；（）和（）

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本题答案：GenBank，EMBL,DDBJ
本题解析：试题答案GenBank，EMBL,DDBJ

6、名词解释  标度树

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本题答案：分支长度与相邻节点对的差异程度成正 比的树。
本题解析：试题答案分支长度与相邻节点对的差异程度成正比的树。

7、名词解释  分子钟

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本题答案：认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说，从而可以通
本题解析：试题答案认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说，从而可以通过分子进化推断出物种起源的时间。

8、单项选择题  EST的含义是（）。

A.表达序列标签
B.序列标签位点
C.高通量基因组序列
D.人工合成序列

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

9、填空题  蛋白质组研究的三大关键核心技术是（）、（）、（）。

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本题答案：双向凝胶电泳技术；质谱鉴定技术；计算机图像数据处理与蛋白质数
本题解析：试题答案双向凝胶电泳技术；质谱鉴定技术；计算机图像数据处理与蛋白质数据库

10、单项选择题  UTR的含义是（）。

A.编码区
B.非编码区
C.低复杂度区域
D.开放阅读框

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

11、单项选择题  构建进化树工具是（）。

A.BLAST
B.ClustalW
C.Mega
D.GCG

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

12、名词解释  系统发育图

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本题答案：用枝长表示进化时间的系统树称为系统发育图，是引入时间概
本题解析：试题答案用枝长表示进化时间的系统树称为系统发育图，是引入时间概念的支序图。

13、问答题来源:91题库网 91eXAm.net  简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系

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本题答案：（1）两者都在打分系统中使用对数比值；
（2）P
本题解析：试题答案（1）两者都在打分系统中使用对数比值；
（2）PAM矩阵是基于近相关蛋白家族数据的，并且假设高度相关蛋白的取代概率可以外推到远相关蛋白的概率。BLOSUM矩阵是基于实际观测到的远相关蛋白比对。
（3）高值BLOSUM矩阵和低值PAM矩阵最适合于研究高度保守的蛋白；低值BLOSUM矩阵和高值PAM矩阵最适合检测远相关蛋白。
（4）一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM要好。对于数据库搜索来说一般选择BLOSUM62矩阵。PAM矩阵可用于寻找蛋白质的进化起源，BLOSUM矩阵用于发现蛋白质的保守域。

14、名词解释  注释（annotation）

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本题答案：对数据库中原始的DNA碱基序列添加相关信息（比如编码的
本题解析：试题答案对数据库中原始的DNA碱基序列添加相关信息（比如编码的基因，氨基酸序列等）或其他的注解。

15、名词解释  多序列比对

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本题答案：通过序列的相似性检索得到许多相似性序列，将这些序列做一
本题解析：试题答案通过序列的相似性检索得到许多相似性序列，将这些序列做一个总体的比对，以观察它们在结构上的异同，来回答大量的生物学问题。

16、问答题  BLAST中，E值和P值分别是什么，它们有什么意义？

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本题答案：BLAST中使用的统计值有概率p值和期望e值。
本题解析：试题答案BLAST中使用的统计值有概率p值和期望e值。
E期望值（E-value）这个数值表示你仅仅因为随机性造成获得这一比对结果的可能次数。这一数值越接近零，发生这一事件的可能性越小。从搜索的角度看，E值越小，比对结果越显著。默认值为10，表示比对结果中将有10个匹配序列是由随机产生，如果比对的统计显著性值（E值）小于该值（10），则该比对结果将被检出，换句话说，比较低的E值将使搜索的匹配要求更严格，结果报告中随机产生的匹配序列减少。
p值表示比对结果得到的分数值的可信度。一般说来，p值越接近于零，则比对结果的可信度越大；相反，p值越大，则比对结果来自随机匹配的可能性越大。

17、名词解释  虚拟细胞

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本题答案：一种建模手段，把细胞定义为许多结构，分子，反应和物质流
本题解析：试题答案一种建模手段，把细胞定义为许多结构，分子，反应和物质流的集合体。

18、问答题  如何进行BLAST结果显著性判断？

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本题答案：结果显著性判断：查看E值列表；查看比对情况。
本题解析：试题答案结果显著性判断：查看E值列表；查看比对情况。
（1.E值是不是显著；
2.两个蛋白质是不是具有近似的大小；
3.两个蛋白质是否有共同的模体或信号序列；
4.两个蛋白质是不是一个合理的多序列比对的一部分；
5.两个蛋白质是否有一个相似的生物学功能；
6.两个蛋白质是否具有相似的3维结构。
7.如果一个BLAST搜索得到一个对另一个蛋白质的边缘匹配，以这个具有较远亲缘关系的蛋白质作为查询项再进行一次新的BLAST搜索。）

19、单项选择题  在真核生物的一个基因内含子两端，即外显子/内含子拼接边界处，其符合（）规则。

A.Kozak
B.AU…AG
C.SD
D.Poly（A）n

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

20、单项选择题  PDB是蛋白质的（）。

A.分类数据库
B.结构数据库
C.模体数据库
D.结构域数据库

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

21、单项选择题  domain的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

22、名词解释  ESI电喷雾离子化

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本题答案：一种适合大分子如蛋白质离子化没有明显降解的质谱技术。<
本题解析：试题答案一种适合大分子如蛋白质离子化没有明显降解的质谱技术。

23、名词解释  promoter

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本题答案：启动子，是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必需的一段DNA
本题解析：试题答案启动子，是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必需的一段DNA序列。

24、单项选择题  利用PubMed文献数据查找发表在“Nature，2012，487（7405）：43-45”上的论文题目是（）。

A.A map of the cis-regulatory sequences in the mouse genome
B.The human CST complex is a terminator of telomerase activity
C.Tumours: Less lactation may explain cancer rise
D.Stem cells: a sporadic super state

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

25、单项选择题  algorithm的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

26、问答题  预测基因的一般步骤是什么？

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本题答案：⑴获取DNA目标序列
⑵查找ORF并将目标序
本题解析：试题答案⑴获取DNA目标序列
⑵查找ORF并将目标序列翻译成蛋白质序列，利用相应工具查找ORF并将DNA序列翻译成蛋白质序列
⑶在数据库中进行序列搜索，利用BLAST进行ORF核苷酸序列和ORF翻译的蛋白质序列搜索
⑷进行目标序列与搜索得到的相似序列的全局对比
⑸查找基因家族进行多序列比对，获得比对区段的基因家族信息
⑹查找目标序列中的特定模序，分别在Prosite、BLOCK、Motif数据库中进行profile、模块（block）、模序（motif）检索⑺预测目标序列蛋白质结构，利用PredictProtein（EMBL）、NNPREDICT等预测目标序列的蛋白质二级结构。

27、名词解释  无根树（unrooted tree）

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本题答案：只表明节点间的关系，无进化发生方向的信息，通过引用外群
本题解析：试题答案只表明节点间的关系，无进化发生方向的信息，通过引用外群或外部参照物种，可以在无根树中指派跟节点。（一种系统发育树，所有在树中的种系的最后共同祖先不显示。）

28、名词解释  外类群

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本题答案：是进化树中处于一组被分析物种之外的，具有相近亲缘关系的
本题解析：试题答案是进化树中处于一组被分析物种之外的，具有相近亲缘关系的物种。

29、单项选择题  OMIM是（）。

A.在线人类孟德尔遗传数据库
B.国家核酸数据库
C.人类基因组计划
D.水稻基因组计划

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

30、多项选择题  人类基因组计划要完成的几张图谱分别是（）

A.物理图谱
B.遗传图谱
C.序列图谱
D.生物图谱
E.基因图谱

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本题答案：A, B, C, E
本题解析：暂无解析

31、名词解释  非信息位点

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本题答案：对于最大简约法来说没有意义的点。
本题解析：试题答案对于最大简约法来说没有意义的点。

32、单项选择题  NCBI中人类无冗余基因数据库是（）。

A.UniGene
B.UniPro
C.UniRef
D.URF

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

33、问答题  试述PSI-BLAST搜索的5个步骤。

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本题答案：[1]选择待查序列（query）和蛋白质数据库；本题解析：试题答案[1]选择待查序列（query）和蛋白质数据库；
[2]PSI-BLAST构建一个多序列比对，然后创建一个序列表谱（profile）又称特定位置打分矩阵（PSSM）；
[3]PSSM被用作query搜索数据库
[4]PSI-BLAST估计统计学意义（eva lues）
[5]重复[3]和[4]，直到没有新的序列发现。

34、问答题  下列数据库分别是什么类型的数据库？

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本题答案：序列数据库中的核酸数据库（GenBankPIRDDBJ
本题解析：试题答案序列数据库中的核酸数据库（GenBankPIRDDBJSWISS-PROTEMBL）
结构数据库（PDB）

35、单项选择题  蛋白质基序（motif）中[ST]的含义是（）。

A.氨基酸为ST
B.氨基酸为S和T
C.氨基酸为S或T
D.除掉S和T之外的任意氨基酸

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

36、问答题  打分矩阵有哪些？

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本题答案：（1）核酸打分矩阵：
等价矩阵、BLAST矩
本题解析：试题答案（1）核酸打分矩阵：
等价矩阵、BLAST矩阵、转换-颠换矩阵
（2）蛋白质打分矩阵：
等价矩阵、氨基酸突变代价矩阵（遗传密码矩阵GCM）、疏水矩阵、PAM矩阵、BLOSUM矩阵。

37、问答题  给定一条序列，简述使用BLAST进行序列比对分析的策略

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本题答案：1）获得查询序列，以FASTA格式黏贴到BLAST文本
本题解析：试题答案1）获得查询序列，以FASTA格式黏贴到BLAST文本框中；
2）选择一个BLAST程序（blastp，blastn，blastx，tblastx，tblastn）；
3）选择一个用于搜索的数据库；
4）为搜索和输出格式选择可选的参数；
5）Search，结果分析。

38、名词解释  EMBL

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本题答案：EMBL实验室—欧洲分子生物学实验室，EM
本题解析：试题答案EMBL实验室—欧洲分子生物学实验室，EMBL数据库—是非盈利性学术组织EMBL建立的综合性数据库，EMBL核酸数据库是欧洲最重要的核酸序列数据库，它定期地与美国的GenBank、日本的DDBJ数据库中的数据进行交换，并同步更新。

39、名词解释  GenBank

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本题答案：是美国全国卫生研究所维护的基因序列数据库，汇集并注释了
本题解析：试题答案是美国全国卫生研究所维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸序列，与日本的DNA数据库DDBJ以及欧洲分子实验室核酸序列数据库EMBL一起，都是国际核苷酸序列数据库合作的成员。

40、问答题  什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵，它们的作用是什么，一般BLAST选择使用的矩阵是什么

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本题答案：PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩
本题解析：试题答案PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵（scoring matrix）。记分矩阵中含有对齐时具体使用的数值。一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩阵供选择，若要进行突变性质的进化分析时可以使用PAM，FASTA缺省推荐BLOSUM50矩阵。
PAM矩阵（Point Accepted Mutation）基于进化的点突变模型，如果两种氨基酸替换频繁，说明自然界接受这种替换，那么这对氨基酸替换得分就高。一个PAM就是一个进化的变异单位, 即1%的氨基酸改变，但这并不意味100次PAM后，每个氨基酸都发生变化，因为其中一些位置可能会经过多次突变，甚至可能会变回到原来的氨基酸。
模块替换矩阵BLOSUM(BLOcks Substitution Matrix)首先寻找氨基酸模式，即有意义的一段氨基酸片断（如一个结构域及其相邻的两小段氨基酸序列），分别比较相同的氨基酸模式之间氨基酸的保守性（某种氨基酸对另一种氨基酸的取代数据），然后，以所有 60％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM60；以所有80％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM80。

41、名词解释  PIR

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本题答案：是一个集成了关于蛋白质功能预测数据的公共资源的数据库，
本题解析：试题答案是一个集成了关于蛋白质功能预测数据的公共资源的数据库，其目的是支持基因组蛋白质研究

42、名词解释  折叠子（Fold）

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本题答案：在两个或更多的蛋白质中具有相似二级结构的大区域，这些大
本题解析：试题答案在两个或更多的蛋白质中具有相似二级结构的大区域，这些大区域具有特定的空间取向。

43、单项选择题  ORF的含义是（）。

A.调控区
B.非编码区
C.低复杂度区域
D.开放阅读框

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

44、填空题  二级结构的三种状态：（），（）和（）

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本题答案：α螺旋；β折叠；β转角
本题解析：试题答案α螺旋；β折叠；β转角

45、问答题  蛋白质二级结构有哪些？

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本题答案：（1）螺旋
（2）b折叠–平行折
本题解析：试题答案（1）螺旋
（2）b折叠–平行折叠反平行折叠
（3）b转角–连接作用”U”型结构（大多Phe，Gly组成）
（4）无规卷曲-没有确定规律性的肽链构象，但仍是紧密有序的稳定结构
（5）无序结构多肽链中有60％的区段为a螺旋和b折叠

46、名词解释  近邻

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本题答案：任意一颗无根树中仅被一个内部节点分隔的一对物种。
本题解析：试题答案任意一颗无根树中仅被一个内部节点分隔的一对物种。

47、名词解释  系统发生（phylogeny）

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本题答案：是指生物种族的进化历史，亦即生物体在整个进化谱
本题解析：试题答案是指生物种族的进化历史，亦即生物体在整个进化谱

48、问答题  双序列比对方法有哪些？

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本题答案：①点阵序列比较(Dot Matrix Sequence
本题解析：试题答案①点阵序列比较(Dot Matrix Sequence Comparison)
②动态规划算法(Dynamic Programming Algorithm)
③词或K串方法(Word or K-tuple Methods)
④贝叶斯统计方法(Bayesian Statistical Methods)

49、名词解释  系统生物学（systems biology）

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本题答案：是研究一个生物系统中所有组分成分（基因、mRNA、蛋白
本题解析：试题答案是研究一个生物系统中所有组分成分（基因、mRNA、蛋白质等）的构成以及在特定条件下这些组分间的相互关系，并分析生物系统在一定时间内的动力学过程

50、名词解释  BLAST

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本题答案：基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行
本题解析：试题答案基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列做相似性比较。

51、名词解释  保守 序列（conserved sequence）

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本题答案：指DNA分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中氨基酸片段，
本题解析：试题答案指DNA分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中氨基酸片段，它们在进化过程中基本保持不变。

52、问答题  生物信息学研究意义？

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本题答案：（1）认识生物本质
了解生物分子信息的组织和
本题解析：试题答案（1）认识生物本质
了解生物分子信息的组织和结构，破译基因组信息，阐明生物信息之间的关系。
（2）改变生物学的研究方式
改变传统研究方式，引进现代信息学方法
（3）在医学上的重要意义
为疾病的诊断和治疗提供依据，为设计新药提供依据

53、填空题  聚类分析方法，分为有（）

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本题答案：监督学习方法，无监督学习方法
本题解析：试题答案监督学习方法，无监督学习方法

54、问答题  简述生物类的数据库类别分为有哪两种及其定义

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本题答案：一级数据库：数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据
本题解析：试题答案一级数据库：数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释（投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白质序列提交到相应的数据库中）
二级数据库：对原始生物分子数据进行整理、分类的结果，是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定的应用目标而建立的。

55、名词解释  MMDB(Molecular Modeling Database)

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本题答案：是（NCBI）所开发的生物信息数据库集成系统Entre
本题解析：试题答案是（NCBI）所开发的生物信息数据库集成系统Entrez的一个部分，数据库的内容包括来自于实验的生物大分子结构数据。与PDB相比，对于数据库中的每一个生物大分子结构，MMDB具有 许多附加的信息，如分子的生物学功能、产生功能的机制、分子的进化历史等，还提供生物大分子三维结构模型显示、结构分析和结构比较工具。

56、单项选择题  从cDNA文库中获得的短序列是（）。

A.STS
B.UTR
C.CDS
D.EST

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

57、单项选择题  利用PubMed文献数据查找论文“A whole-cell computational model predicts phenotype from genotype”发表在Cell期刊的（）。

A.第50卷第1期第389-391页
B.第50卷第1期第389-401页
C.第150卷第2期第389-401页
D.第125卷第2期第389-391页

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

58、名词解释  CpG island

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本题答案：是DNA上的一个区域，富含GC，两者以磷酸酯键相连，长
本题解析：试题答案是DNA上的一个区域，富含GC，两者以磷酸酯键相连，长度约几百到几千bp不等，常出现在管家基因或频繁表达的基因的启动子附近，在这些部位，CpG岛具有阻止序列甲基化的作用。

59、问答题  MEGA2如何将其它多序列比对格式文件转化为MEGE格式的多序列比对文件？

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本题答案：（1）选择菜单file，
（2）选择Text
本题解析：试题答案（1）选择菜单file，
（2）选择Text File Editorand Format Coverter工具，
（3）调入需要转换的序列和相应的格式，
（4）获得转换后的MEGA格式的文件并保存。

60、名词解释  打分矩阵（scoring matrix）

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本题答案：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理
本题解析：试题答案在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法。

61、问答题  如何处理BLAST后过少或过多的结果？

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本题答案：如何处理过多的结果：限定数据库：Refseq；限定生物
本题解析：试题答案如何处理过多的结果：限定数据库：Refseq；限定生物体；利用序列的特定部分搜索；调整打分矩阵；调整E值。处理过少的结果：去掉数据库限定，进行多个数据库搜索；提高E值；尝试更高的PAM矩阵和更低的BLOSUM矩阵；去掉物种限制；进行高级比对搜索。

62、单项选择题  被誉为“生物信息学之父”的科学家是（）。

A.Dulbecco
B.Sanger
C.吴瑞
D.林华安

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

63、问答题  序列的相似性与同源性有什么区别与联系？

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本题答案：相似性是指序列之间相关的一种量度，两序列的的相似性可以
本题解析：试题答案相似性是指序列之间相关的一种量度，两序列的的相似性可以基于序列的一致性的百分比；而同源性是指序列所代表的物种具有共同的祖先，强调进化上的亲缘关系。

64、单项选择题  生物信息学主要是利用哪种工具实现对生命科学研究中生物信息的存储、检索和分析的？（）

A.计算机
B.iPhone
C.人造卫星
D.手机

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

65、名词解释  顺式调控元件

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本题答案：位于起始点上游（基因5‘端）控制转录的DN
本题解析：试题答案位于起始点上游（基因5‘端）控制转录的DNA序列，靠近它所调控的编码序列；其结构是模块化的，即DNA序列能被分成各个单元。

66、单项选择题  SAGE的含义是（）。

A.基因表达连续分析
B.聚丙烯酰胺凝胶电泳
C.基因组分析
D.双向电泳分析

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

67、问答题  真核基因结构识别主要包含哪些内容？

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本题答案：（1）ORF识别及其可靠性验证：确定DNA序列的编码区
本题解析：试题答案（1）ORF识别及其可靠性验证：确定DNA序列的编码区
（2）启动子及转录因子结合位点分析：CAP序列、识别区、解旋区、转录起始位点
（3）重复序列分析：哺乳动物基因组中存在大量重复序列，由于重复序列的大量存在常会影响序列的正确分析，因此在对真核基因进行分析前，最好能把重复序列找出来，并从序列中屏蔽掉
（4）CpGisland：可以为基因及其启动子的预测提供重要的线索
（5）3’UTR区：真核生物的转录终止信号是在3’UTR区

68、名词解释  HGP(human genome project)

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本题答案：人类基因组计划，1990年由美国能源部（DOE）和国立
本题解析：试题答案人类基因组计划，1990年由美国能源部（DOE）和国立健康研究院（NIH）资助的一个研究计划。
目的是：
①鉴定出人类的所有基因；
②确定构成人类基因组的约30亿个碱基对的序列；
③将上述信息储存于专门的数据库中，并开发出相应的分析工具；
④研究由此而产生的伦理、法律和社会问题并提出相应对策。

69、单项选择题  GenBank数据库中的登录号AAR19268是（）。

A.水稻的DNA序列
B.水稻的蛋白质序列
C.人类的DNA序列
D.人类的蛋白质序列

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

70、问答题  你认为，什么是生物信息学？

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本题答案：采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种
本题解析：试题答案采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种生物信息（包括核酸、蛋白质等）的收集、加工、储存、分析、解释的一门学科。

71、问答题  UniGene数据库主要收集什么样的数据？

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本题答案：UniGene数据库称得上是一个实验性质的系统，它通过
本题解析：试题答案UniGene数据库称得上是一个实验性质的系统，它通过程序自动将GenBank中的基因序列划分到某个非冗余的基于基因的集合中。这样，每个UniGene集合就代表了一个独特的基因，并包含了与这个基因相关的信息。

72、问答题  简述邻接法（NJ）构树的算法思想。

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本题答案：邻接法的思想不仅仅计算最小两两比对距离，还对整个树的长
本题解析：试题答案邻接法的思想不仅仅计算最小两两比对距离，还对整个树的长度进行最小化，从而对树的拓扑结构进行限制。这种算法由一棵星状树开始，所有的物种都从一个中心节点出发，然后通过计算最小分支长度的和相继寻找到近邻的两个序列，每一轮过程中考虑所有可能的序列对，把能使树的整个分支长度最小的序列对一组，从而产生新的距离矩阵，直到寻找所有的近邻序列。

73、名词解释  E值

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本题答案：衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以
本题解析：试题答案衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义。

74、名词解释  分子进化树（molecular evolutionary tree）

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本题答案：在研究生物进化和系统分类中，常用一种类似树状分支的图形
本题解析：试题答案在研究生物进化和系统分类中，常用一种类似树状分支的图形来概括各种（类）生物之间的亲缘关系，这种树状分支的图形成为系统发育树（phylogenetictree）。

75、问答题  什么是序列比对？及其基本分类？

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本题答案：序列比对（Sequence Alignment）是通过
本题解析：试题答案序列比对（Sequence Alignment）是通过在序列中搜索一系列单个性状或性状模式来比较2个（双序列比对）或更多（多重序列比对）序列的方法。
序列比对的分类：
A、双序列比对：两条序列的比对。
B、多序列比对：三条或以上序列的比对

76、填空题  2-DE的基本原理是根据蛋白质（）和（）不同，进行两次电泳将之分离。第一向是（），第二向是（）。

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本题答案：等电点；分子量；等电聚焦分离；SDS-PAGE分离
本题解析：试题答案等电点；分子量；等电聚焦分离；SDS-PAGE分离

77、单项选择题  下列Fasta格式正确的是（）。

A.seq1：agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
B.>seq1agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
C.seq1：agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
D.>seq1agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

78、名词解释  分子途径

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本题答案：是指一组连续起作用以达到共同目标的蛋白质。
本题解析：试题答案是指一组连续起作用以达到共同目标的蛋白质。

79、名词解释  开放阅读框（ORF）

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本题答案：开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱
本题解析：试题答案开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列。

80、单项选择题  Entrez使用几种逻辑运算符对检索关键词做最基本的限制？（）

A.1种
B.2种
C.3种
D.4种

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

81、问答题  国际上权威的核酸序列数据库有那些？

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本题答案：（1）欧洲分子生物学实验室的EMBL。
（2
本题解析：试题答案（1）欧洲分子生物学实验室的EMBL。
（2）美国生物技术信息中心的GenBank。
（3）日本遗传研究所的DDBJ。

82、多项选择题  RFLP是DNA多态性中最多见的一种，它产生的机制包括（）

A.DNA分子产生突变，使某些酶切位点数增加
B.DNA分子产生突变，使某些酶切位点数减少
C.限制性酶切位点之间重复序列数目变异
D.限制性酶星活性
E.限制性酶切位点前后的DNA片断发生插入或删除

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本题答案：A, B, E
本题解析：暂无解析

83、问答题  TSS，外显子和内含子的概念。

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本题答案：TSS是转录起始位点（Transcription St
本题解析：试题答案TSS是转录起始位点（Transcription Start Site）的英文缩写，是指DNA上一段与RNA聚合酶结合并起始转录的一段DNA序列。真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。其中的编码区即为外显子，非编码区即为内含子。

84、单项选择题  LCR的含义是（）。

A.编码区
B.非编码区
C.低复杂度区域
D.开放阅读框

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

85、名词解释  序列注释

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本题答案：是指从原始序列数据中获得有用的生物学信息。这主要是指基
本题解析：试题答案是指从原始序列数据中获得有用的生物学信息。这主要是指基因组DNA中寻找基因和其他功能元件（结构注释），并给出这些序列的功能（功能注释）。

86、问答题  分子途径和网络的特点

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本题答案：1）分子途径和网络的结构随意性大。图可以很简单，也可以
本题解析：试题答案1）分子途径和网络的结构随意性大。图可以很简单，也可以非常复杂。它们可能包含了多个分支，盘绕的连接和回路。
2）它们通常也显示出节点间关系的方向，例如表示出代谢通路或信号传导的方向。调控途径和网络的图也应该说明相互作用是正的还是负的。正的相互作用（促进或者活化作用）常常用箭头表示，而负的交互效应（抑制或者失活作用）常常用T型棒表示。

87、单项选择题  analogy的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

88、问答题  简述人类基因组研究计划的历程。

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本题答案：通过国际合作，用15年时间（1990-2005）至少投
本题解析：试题答案通过国际合作，用15年时间（1990-2005）至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10来源:91exam .net万基因，并对其他生物进行类似研究。
1990，人类基因组计划正式启动。
1996，完成人类基因组计划的遗传作图，启动模式生物基因组计划。
1998完成人类基因组计划的物理作图，开始人类基因组的大规模测序。Celera公司加入，与公共领域竞争启动水稻基因组计划。
1999，第五届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度。
2000，Celera公司宣布完成果蝇基因组测序，国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基因组的测序工作。
2001，人类基因组“中国卷”的绘制工作宣告完成。
2003，中、美、日、德、法、英等6国科学家宣布人类基因组序列图绘制成功，人类基因组计划的.目标全部实现。
2004，人类基因组完成图公布

89、名词解释  PROSITE

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本题答案：是蛋白质家族和结构域数据库，包含具有生物学意义的位点、模式、
本题解析：试题答案是蛋白质家族和结构域数据库，包含具有生物学意义的位点、模式、可帮助识别蛋白质家族的统计特征。PROSITE中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或其它蛋白质结合的区域等；PROSITE还包括根据多序列比对而构建的序列统计特征，能更敏感地发现一个序列是否具有相应的特征。

90、问答题  HGP选择作为研究人类的四大“模式生物“有哪些？

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本题答案：酵母、线虫、果蝇、小鼠。
本题解析：试题答案酵母、线虫、果蝇、小鼠。

91、单项选择题  利用中国知网文献数据库（中国知网）查找论文题目是“黄瓜对不同温度逆境的抗性研究”作者的单位是（）。

A.天津市黄瓜研究所
B.中国农业科学院
C.中国科学院
D.中国农业大学

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

92、问答题  如何检测DNA序列中潜在的CDS？

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本题答案：对任意一个DNA序列，可能并不知道哪一个碱基代表CDS
本题解析：试题答案对任意一个DNA序列，可能并不知道哪一个碱基代表CDS的起始。这种情况下，不妨试用六框翻译（six-frame translation）。如图4-2给定一个DNA序列，可以利用遗传密码将其翻译为蛋白质序列，这种方式称为概念性翻译（conceptual translation）。与基于生化实验的蛋白质翻译不同的是，概念性翻译仅通过理论推导或计算获得。
六框翻译通过移动阅读框起始碱基，获得6个潜在的蛋白质序列。其中，3个是正向翻译，3个是反向翻译，6种可能的蛋白质中至多只有一种是正确的。

93、单项选择题  提交序列到GenBank中，使用的程序可以是（）。

A.Entrez
B.SRS
C.Medline
D.BankIt

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

94、名词解释  模块替换矩阵（BLUSUM）

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本题答案：在替换矩阵中，每个位置的打分是在相关蛋白局部比对模块中
本题解析：试题答案在替换矩阵中，每个位置的打分是在相关蛋白局部比对模块中观察到的替换的频率而获得的，每个矩阵被修改成一个特殊的进化距离。

95、名词解释  Ab initio prediction

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本题答案：蛋白质三级结构预测方法—从头预测法，在既没有已知结构的同源蛋
本题解析：试题答案蛋白质三级结构预测方法—从头预测法，在既没有已知结构的同源蛋白质、也没有已知结构的远程同源蛋白质的情况下，只能采用从头预测方法，即（直接）仅仅根据序列本身来预测其结构。

96、单项选择题  GenBank数据库的基本信息单位是（）。

A.FASTA
B.GBFF
C.GCG
D.ASN.1

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

97、填空题  高分值局部联配的BLAST参数是（）（高分值片段对），（）（期望值）

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本题答案：HSPs；E
本题解析：试题答案HSPs；E

98、名词解释  heptad repeat

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本题答案：七肽重复区是典型的卷曲螺旋结构类型之一，由多个七肽单元
本题解析：试题答案七肽重复区是典型的卷曲螺旋结构类型之一，由多个七肽单元连接而成的重复序列。

99、问答题  什么是动态规划算法？

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本题答案：动态规划算法（Dynamic Programming
本题解析：试题答案动态规划算法（Dynamic Programming Algorithm）是一种计算方法，它的主要思路是把一个问题分成若干个小问题来解决，在序列比对尤其是双序列比对中非常重要，因为其提供了序列间最优的对位排列。在生物学中应用的两种动态规划算法：Needleman-Wunsch算法（全局比对）和Smith-Waterman算法（局部比对）。

100、问答题  什么是物种的标记序列？

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本题答案：指物种特有的一段核苷酸序列。可以通过相似性查询，得到某
本题解析：试题答案指物种特有的一段核苷酸序列。可以通过相似性查询，得到某一序列在数据库中的某一物种中反复出现，且在其他物种中没有的明显相似的序列。