1、问答题  MEGA2如何将其它多序列比对格式文件转化为MEGE格式的多序列比对文件？

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本题答案：（1）选择菜单file，
（2）选择Text
本题解析：试题答案（1）选择菜单file，
（2）选择Text File Editorand Format Coverter工具，
（3）调入需要转换的序列和相应的格式，
（4）获得转换后的MEGA格式的文件并保存。

2、单项选择题  利用中国知网文献数据库（中国知网）查找论文题目是“黄瓜对不同温度逆境的抗性研究”作者的单位是（）。

A.天津市黄瓜研究所
B.中国农业科学院
C.中国科学院
D.中国农业大学

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

3、单项选择题  利用中国知网文献数据库（中国知网）查找论文题目是“黄瓜无毛突变体叶片叶绿体超微结构与光合特性”第一作者是（）。

A.曹辰兴
B.张松
C.郭红芸
D.郭延奎

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

4、名词解释  蛋白质组（proteome）

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本题答案：是指一个基因组、一种生物或一个细胞/组织的基因组所表达的全套
本题解析：试题答案是指一个基因组、一种生物或一个细胞/组织的基因组所表达的全套蛋白质。

5、填空题  蛋白质质谱数据搜索工具：（）

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本题答案：SEQUEST
本题解析：试题答案SEQUEST

6、多项选择题  分析EST序列时首要注意以下几点（）

A.EST序列中除了A\G\T\C外，可能出现未知碱基
B.EST只是单次测序，得 出的结果没有可信度
C.EST序列中可能出现错误的插入和缺失，导致读码框移位
D.某个EST序列是数据库中另一序列的一个片段
E.某个EST序列不在基因的编码区内

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本题答案：A, C, D, E
本题解析：暂无解析

7、问答题  NCBI维护的核苷酸数据库由哪几部分组成的，其主要的内容是什么？

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本题答案：由三部分组成：表达序列标签序列、基因组测序序列、核心核
本题解析：试题答案由三部分组成：表达序列标签序列、基因组测序序列、核心核苷酸序列。

8、名词解释  EMBL

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本题答案：EMBL实验室—欧洲分子生物学实验室，EM
本题解析：试题答案EMBL实验室—欧洲分子生物学实验室，EMBL数据库—是非盈利性学术组织EMBL建立的综合性数据库，EMBL核酸数据库 是欧洲最重要的核酸序列数据库，它定期地与美国的GenBank、日本的DDBJ数据库中的数据进行交换，并同步更新。

9、问答题  生物信息指哪些？

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本题答案：主要有从DNA序列、蛋白质序列、蛋白质结构和功能研究中
本题解析：试题答案主要有从DNA序列、蛋白质序列、蛋白质结构和功能研究中解读的：遗传信息、进化信息、结构和功能信息。

10、名词解释  低复杂度区域

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本题答案：BLAST搜索的过滤选项。指序列中包含的重复度高的区域
本题解析：试题答案BLAST搜索的过滤选项。指序列中包含的重复度高的区域，如poly（A）。

11、单项选择题  RGP是（）。

A.在线人类孟德尔遗传数据
B.国家核酸数据库
C.人类基因组计划
D.水稻基因组计划

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

12、名词解释  FASTA序列格式

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本题答案：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨
本题解析：试题答案是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（>）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。

13、多项选择题  （）是现在国际上最主要的三大核酸序列数据库

A.EMBL
B.DDBJ
C.GenBank
D.NCBI
E.EBI

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本题答案：A, B, C
本题解析：暂无解析

14、名词解释  EST

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本题答案：表达序列标签—是从一个随机选择的cDNA克
本题解析：试题答案表达序列标签—是从一个随机选择的cDNA克隆，进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA部分序列，代表一个完整基因的一小部分

15、问答题  分子途径和网络的特点

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本题答案：1）分子途径和网络的结构随意性大。图可以很简单，也可以
本题解析：试题答案1）分子途径和网络的结构随意性大。图可以很简单，也可以非常复杂。它们可能包含了多个分支，盘绕的连接和回路。
2）它们通常也显示出节点间关系的方向，例如表示出代谢通路或信号传导的方向。调控途径和网络的图也应该说明相互作用是正的还是负的。正的相互作用（促进或者活化作用）常常用箭头表示，而负的交互效应（抑制或者失活作用）常常用T型棒表示。

16、名词解释  除权配对算法（UPGMA）

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本题答案：最初，每个序列归为一类，然后找到距离最近的两类将其归为
本题解析：试题答案最初，每个序列归为一类，然后找到距离最近的两类将其归为一类，定义为一个节点，重复这个过程，直到所有的聚类被加入，最终产生树根。

17、问答题  试述蛋白质三维结构预测的三类方法

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本题答案：（1）同源建模，对于一个未知结构的蛋白质，找到一个已知
本题解析：试题答案（1）同源建模，对于一个未知结构的蛋白质，找到一个已知结构的同源蛋白质，以该蛋白质的结构为模板，为未知结构的蛋白质建立结构模型，序列相似性低于30%的蛋白质难以得到理想的结构模型；
（2）在已知结模板的序列一致率小于25%时，使用折叠识别方法进行预测；
（3）在找不到已知结构的蛋白质模板时使用从头预测的方法。

18、问答题  生物信息学数据库的组成包括哪些部分？数据库有哪些类型？

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本题答案：生物信息学数据库的组成包括一级数据库和二级数据库。数据
本题解析：试题答案生物信息学数据库的组成包括一级数据库和二级数据库。数据库的类型包括核算和蛋白质一级结构序列数据库、基因组数据库、生物大分子三维空间结构数据库、以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库。

19、单项选择题  algorithm的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

20、名词解释  最大似然法（ML）

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本题答案：它对每个可能的进化位点分配一个概率，然后综合所有位点，找到概
本题解析：试题答案它对每个可能的进化位点分配一个概率，然后综合所有位点，找到概率最大的进化树。最大似然法允许采用不同的进化模型对变异进行分析评估，并在此基础上构建系统发育树。

21、填空题  高分值局部联配的BLAST参数是（）（高分值片段对），（）（期望值）

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本题答案：HSPs；E
本题解析：试题答案HSPs；E

22、单项选择题  analogy的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

23、名词解释  互补序列（complementary sequence）

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本题答案：能够与其他DNA片段根据碱基互补序列（A与T配对，G与
本题解析：试题答案能够与其他DNA片段根据碱基互补序列（A与T配对，G与C配对）形成两练结构的核苷酸序列。

24、问答题  你认为生物信息学有什么用？对你的生活、研究有影响吗？

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本题答案：（1）主要用于：
在基因组分析方面：生物序列相似
本题解析：试题答案（1）主要用于：
在基因组分析方面：生物序列相似性比较及其数据库搜索、基因预测、基因组进化和分子进化、蛋白质结构预测等
在医药方面：新药物设计、基因芯片疾病快速诊断、流行病学研究：SARS、人类基因组计划、基因组计划：基因芯片。
（2）指导研究和实验方案，减少操作性实验的量；验证实验结果；为实验结果提供更多的支持数据等材料。

25、问答题  生物信息学步入后基因组时代后，其发展方向有哪几个方面。

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本题答案：生物信息学步入后基因组时代后，其发展方向主要有：本题解析：试题答案生物信息学步入后基因组时代后，其发展方向主要有：
①各种生物基因组测序及新基因的发现；
②单核苷酸多态性（SNP）分析；
③基因组非编码区信息结构与分析；
④比较基因组学和生物进化研究；
⑤蛋白质结构和功能的研究。

26、单项选择题  GenBank数据库的基本信息单位是（）。

A.FASTA
B.GBFF
C.GCG
D.ASN.1

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

27、问答题  以下软件的主要用途是什么？

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本题答案：RepeatMasker, CpGPlot, Spli
本题解析：试题答案RepeatMasker, CpGPlot, Splice View, Genscan, ORF finder, neural network promoter prediction.
答：RepeatMasker：是对重复序列进行分析的软件
GpGPlot：用来查找一条DNA序列中CpG岛，使用Gardine-Garden和Frommer描述的方法
Splice View：是对一段序列进行剪接位点的分析即其中的受体和供体位点
Genscan：是一种从头分析工具
ORF finder：是用来分析序列ORF的工具
neural networkpromoter prediction：神经网络启动子预测是另外一种分析启动子的方法

28、单项选择题  motif的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

29、多项选择题  下列哪些分子类型属于非蛋白质编码区（）

A.内含子
B.卫星DNA
C.伪基因
D.启动子
E.增强子

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本题答案：A, B, C, D, E
本题解析：暂无解析

30、名词解释  BLASTp

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本题答案：是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列
本题解析：试题答案是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。

31、名词解释  系统发育分析

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本题答案：通过一组相关的基因或者蛋白质的多序列比对或其他性状，可
本题解析：试题答案通过一组相关的基因或者蛋白质的多序列比对或其他性状，可以研究推断不同物种或基因之间的进化关系。

32、名词解释  聚类分析

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本题答案：就是将数据分成若干簇（cluster），簇内最大程度相
本题解析：试题答案就是将数据分成若干簇（cluster），簇内最大程度相似，簇间最大程度相异。某一状态的出现概率仅取决于其前驱的k个状态，k阶马尔可夫模型

33、单项选择题  accession number的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

34、名词解释  molecular phylogenetic tree

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本题答案：分子进化树，精确地反映物种间或群体间在进化过程中发生的
本题解析：试题答案分子进化树，精确地反映物种间或群体间在进化过程中发生的极微细的遗传变异，而且借助化石提供的大分子类群的分化年代能定量地估计出物种间或群体间的分化年代。

35、名词解释  二级数据库

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本题答案：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍
本题解析：试题答案在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步的整理。

36、问答题  我国自主知识产权的主要基因组测序计划有哪些？

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本题答案：水稻（来源：www.91exam.org2002），家鸡（2004），家蚕（2007），
本题解析：试题答案水稻（2002），家鸡（2004），家蚕（2007），家猪（2012），大熊猫（2010）

37、名词解释  空位（gap）

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本题答案：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点
本题解析：试题答案在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。

38、问答题  GEO数据库主要收集的是什么样的数据？

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本题答案：基因表达精选集（GEO）数据库存储的是一些准确的基因表
本题解析：试题答案基因表达精选集（GEO）数据库存储的是一些准确的基因表达图谱数据和大规模的分子实验数据

39、名词解释  相似性

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本题答案：是可以量化的参数，是一种直接的数量关系，是量的判断，可
本题解析：试题答案是可以量化的参数，是一种直接的数量关系，是量的判断，可多可少，如百分之几。

40、单项选择题  GenBank登录号为SCU49845的序列，其DNA产度是（）。

A.1028bp
B.3028bp
C.4028bp
D.5028bp

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

41、名词解释  旁系（并系）同源

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本题答案：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因重复产生的一组基因
本题解析：试题答案指同一个物种中具有共同祖先，通过基因重复产生的一组基因，这些基因在功能上可能发生了改变。（书：由于基因重复事件产生的相似序列。）

42、问答题  PCR引物设计有哪些原则？

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本题答案：⑴产物不能形成二级结构；
⑵引物长度一般在1
本题解析：试题答案⑴产物不能形成二级结构；
⑵引物长度一般在15~30个碱基之间；
⑶G+C含量在40％~60％之间；⑷碱基要随机分布；
⑸引物自身不能有连续4个碱基互补；
⑹引物之间不能有连续4个碱基的互补；
⑺引物端可以修饰；
⑻引物不可修饰；
⑼引物端要避开密码子的第三位。

43、名词解释  多序列比对（multiple sequence alignment）

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本题答案：三个或多个序列之间的比对，如果序列在同一列有相同结构位
本题解析：试题答案三个或多个序列之间的比对，如果序列在同一列有相同结构位置的残基和（或）祖传的残基，则会在该位置插入空位。

44、名词解释  单基因回路

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本题答案：蛋白质与DNA启动子和增强子的相互作用。
本题解析：试题答案蛋白质与DNA启动子和增强子的相互作用。

45、名词解释  MEGA(Molecular Evolutionary Genetics Analysis)

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本题答案：是一款免费的构树软件，它提供了序列比对、格式转换、数据
本题解析：试题答案是一款免费的构树软件，它提供了序列比对、格式转换、数据修订、距离计算、系统树重建和可信度评估等全套功能，能对DNA、mRNA氨基酸序列及遗传距离进行系统发生分析以及基因分化年代的分析。

46、问答题  BLAST应用有哪些？

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本题答案：BLAST应用：
1.是序列分析的基础； 本题解析：试题答案BLAST应用：
1.是序列分析的基础；
2.评价实验结果；
3.为实验提供新思路，并指导进一步实验设计；
4.是寻找和鉴定新基因的重要手段；
5.是蛋白质结构预测和分子设计的基础；
6.是研究生物进化和种属分类的基本方法。

47、名词解释  PSI-BLAST

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本题答案：位点特异性迭代比对。是一种专门化的的比对，通过调节序列打分矩
本题解析：试题答案位点特异性迭代比对。是一种专门化的的比对，通过调节序列打分矩阵（scoringmatrix）探测远缘相关的蛋白。

48、填空题  蛋白质组研究的三大关键核心技术是（）、（）、（）。

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本题答案：双向凝胶电泳技术；质谱鉴定技术；计算机图像数据处理与蛋白质数
本题解析：试题答案双向凝胶电泳技术；质谱鉴定技术；计算机图像数据处理与蛋白质数据库

49、名词解释  反式调控元件

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本题答案：远离所调控的编码序列，通常位于不同的染色体上。
本题解析：试题答案远离所调控的编码序列，通常位于不同的染色体上。

50、填空题  系统发育树的构建方法：（）

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本题答案：距离矩阵法，最大简约法和最大似然法
本题解析：试题答案距离矩阵法，最大简约法和最大似然法

51、问答题  简述序列比对两种类型。

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本题答案：（1）全局序列比：在全局范围内对两条序列进行比对打分的
本题解析：试题答案（1）全局序列比：在全局范围内对两条序列进行比对打分的方法，适合于非常相似且长度近似相等的序列
（2）局部序列比对：一种寻找匹配子序列的序列比对方法，适合于一些片段相似而另一些片段相异的序列

52、名词解释  系统发生（phylogeny）

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本题答案：是指生物种族的进化历史，亦即生物体在整个进化谱
本题解析：试题答案是指生物种族的进化历史，亦即生物体在整个进化谱

53、名词解释  替换（substitution）

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本题答案：在指定的位置不相同的氨基酸进行连配，如果联配的残基有相
本题解析：试题答案在指定的位置不相同的氨基酸进行连配，如果联配的残基有相似的物化性质，那么替换是保守的。

54、填空题  质谱的两个数据库搜索工具：（）和（）

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本题答案：SEQEST；Lutkefish
本题解析：试题答案SEQEST；Lutkefish

55、填空题  用于蛋白质二级结构预测的基本神经网络模型为三层的前馈网络，包括（）

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本题答案：输入层，隐含层和输出层
本题解析：试题答案输入层，隐含层和输出层

56、填空题  初级序列数据库：（）

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本题答案：GenBank，EMBL和DDBJ
本题解析：试题答案GenBank，EMBL和DDBJ

57、单项选择题  Entrez使用几种逻辑运算符对检索关键词做最基本的限制？（）

A.1种
B.2种
C.3种
D.4种

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

58、问答题  简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系

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本题答案：（1）两者都在打分系统中使用对数比值；
（2）P
本题解析：试题答案（1）两者都在打分系统中使用对数比值；
（2）PAM矩阵是基于近相关蛋白家族数据的，并且假设高度相关蛋白的取代概率可以外推到远相关蛋白的概率。BLOSUM矩阵是基于实际观测到的远相关蛋白比对。
（3）高值BLOSUM矩阵和低值PAM矩阵最适合于研究高度保守的蛋白；低值BLOSUM矩阵和高值PAM矩阵最适合检测远相关蛋白。
（4）一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM要好。对于数据库搜索来说一般选择BLOSUM62矩阵。PAM矩阵可用于寻找蛋白质的进化起源，BLOSUM矩阵用于发现蛋白质的保守域。

59、填空题  初级序列数据库（）；（）和（）

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本题答案：GenBank，EMBL,DDBJ
本题解析：试题答案GenBank，EMBL,DDBJ

60、名词解释  ncRNA

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本题答案：非编码RNA，是指没有编码蛋白质功能的所有RNA，它缺乏开放
本题解析：试题答案非编码RNA，是指没有编码蛋白质功能的所有RNA，它缺乏开放阅读框，常由编码蛋白质的基因反转录而来。

61、名词解释  马尔可夫链

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本题答案：具有马尔可夫特性的离散状态随机过程。
本题解析：试题答案具有马尔可夫特性的离散状态随机过程。

62、问答题  简述人类基因组研究计划的历程。

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本题答案：通过国际合作，用15年时间（1990-2005）至少投
本题解析：试题答案通过国际合作，用15年时间（1990-2005）至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其他生物进行类似研究。
1990，人类基因组计划正式启动。
1996，完成人类基因组计划的遗传作图，启动模式生物基因组计划。
1998完成人类基因组计划的物理作图，开始人类基因组的大规模测序。Celera公司加入，与公共领域竞争启动水稻基因组计划。
1999，第五届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度。
2000，Celera公司宣布完成果蝇基因组测序，国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基因组的测序工作。
2001，人类基因组“中国卷”的绘制工作宣告完成。
2003，中、美、日、德、法、英等6国科学家宣布人类基因组序列图绘制成功，人类基因组计划的.目标全部实现。
2004，人类基因组完成图公布

63、名词解释  基因预测的从头分析

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本题答案：依据综合利用基因的特征，如剪接位点，内含子与外显子边界
本题解析：试题答案依据综合利用基因的特征，如剪接位点，内含子与外显子边界，调控区，预测基因组序列中包含的基因。

64、名词解释  分子钟

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本题答案：认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说，从而可以通
本题解析：试题答案认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说，从而可以通过分子进化推断出物种起源的时间。

65、单项选择题  多序列比对工具是（）。

A.BLAST
B.ClustalW
C.Mega
D.GCG

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

66、单项选择题  DNA中Tm值与（）含量成正比。

A.G+A
B.G+C
C.T+C
D.A+T

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

67、多项选择题  下面序列哪些为反向重复序列（）

A.…GCACTTG…GCACTTG…
B.…GCACTTGCAAGTGC…；…CGTGAAC…CGTGAAC…；…CGTGAACGTTCACG…
C.…GCACTTG…CAAGTGC…
D.…GCACTAGCTAGCGG…；…CGTGAAC…GTTCACG…；…CGTGATCGATCGCC…

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本题答案：B, D
本题解析：暂无解析

68、名词解释  标度树（scaled tree）

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本题答案：分支长度与相邻节点对的差异程度成正比的树。
本题解析：试题答案分支长度与相邻节点对的差异程度成正比的树。

69、名词解释  序列注释

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本题答案：是指从原始序列数据中获得有用的生物学信息。这主要是指基
本题解析：试题答案是指从原始序列数据中获得有用的生物学信息。这主要是指基因组DNA中寻找基因和其他功能元件（结构注释），并给出这些序列的功能（功能注释）。

70、名词解释  PAM矩阵

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本题答案：PAM指可接受突变百分率。一个氨基酸在进化中变成另一种
本题解析：试题答案PAM指可接受突变百分率。一个氨基酸在进化中变成另一种氨基酸的可能性，通过这种可能性可以鉴定蛋白质之间的相似性，并产生蛋白质之间的比对。一个PAM单位是蛋白质序列平均发生1%的替代量需要的进化时间。

71、问答题  为什么要构建生物分子数据库。

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本题答案：（1）生物分子数据高速增长
（2）分子生 物学
本题解析：试题答案（1）生物分子数据高速增长
（2）分子生物学及相关领域研究人员迅速获得最新实验数据。

72、名词解释  点矩阵（dot matrix）

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本题答案：构建一个二维矩阵，其X轴是一条序列，Y轴是另一个序列，
本题解析：试题答案构建一个二维矩阵，其X轴是一条序列，Y轴是另一个序列，然后在2个序列相同碱基的对应位置（x，y）加点，如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线，如果两条序列相似则会出现一条或者几条直线；如果完全没有相似性则不能连成直线。

73、名词解释  一致树（consensus tree）

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本题答案：在同一算法中产生多个最优树，合并这些最优树得到的树即一
本题解析：试题答案在同一算法中产生多个最优树，合并这些最优树得到的树即一致树。

74、名词解释  距离法

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本题答案：首先通过各个物种之间的比较，根据一定的假设（进化距离模型）推
本题解析：试题答案首先通过各个物种之间的比较，根据一定的假设（进化距离模型）推导得出分类群之间的进化距离，构建一个进化距离矩阵。其次基于这个矩阵中的进化距离关系构建进化树。

75、问答题  生物分子数据类型有哪些？

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本题答案：DNA序列数据、蛋白质序列数据、生物分子结构数据、生物分子功
本题解析：试题答案DNA序列数据、蛋白质序列数据、生物分子结构数据、生物分子功能数据

76、单项选择题  Blast结果中HSP的含义是（）。

A.空位
B.期望值
C.过滤
D.高分配对片段

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

77、问答题  什么简约信息位点Pi？

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本题答案：指基于DNA或蛋白质序列，应用最大简约法构建系统发育树
本题解析：试题答案指基于DNA或蛋白质序列，应用最大简约法构建系统发育树时，如果某个位点的状态存在两种或两种以上，每种状态出现两次或两次以上，这样的位点称简约信息位点。

78、问答题  预测蛋白质三级结构的三种方法

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本题答案：1）同源建模法：依据蛋白质与已知结构蛋白比对信息构建3
本题解析：试题答案1）同源建模法：依据蛋白质与已知结构蛋白比对信息构建3D模型；
2）折叠识别法：寻找与未知蛋白最合适的模板，进行序列与结构比对，最终建立结构模型；
3）从头预测法：根据序列本身从头预测蛋白质结构。

79、问答题  什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵，它们的作用是什么，一般BLAST选择使用的矩阵是什么

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本题答案：PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩
本题解析：试题答案PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵（scoring matrix）。记分矩阵中含有对齐时具体使用的数值。一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩阵供选择，若要进行突变性质的进化分析时可以使用PAM，FASTA缺省推荐BLOSUM50矩阵。
PAM矩阵（Point Accepted Mutation）基于进化的点突变模型，如果两种氨基酸替换频繁，说明自然界接受这种替换，那么这对氨基酸替换得分就高。一个PAM就是一个进化的变异单位, 即1%的氨基酸改变，但这并不意味100次PAM后，每个氨基酸都发生变化，因为其中一些位置可能会经过多次突变，甚至可能会变回到原来的氨基酸。
模块替换矩阵BLOSUM(BLOcks Substitution Matrix)首先寻找氨基酸模式，即有意义的一段氨基酸片断（如一个结构域及其相邻的两小段氨基酸序列），分别比较相同的氨基酸模式之间氨基酸的保守性（某种氨基酸对另一种氨基酸的取代数据），然后，以所有 60％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM60；以所有80％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM80。

80、单项选择题  Entrez数据库中的剪贴板的容量是（）。

A.500条记录
B.1000条记录
C.5000条记录
D.10000条记录

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

81、问答题  简述邻接法（NJ）构树的算法思想。

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本题答案：邻接法的思想不仅仅计算最小两两比对距离，还对整个树的长
本题解析：试题答案邻接法的思想不仅仅计算最小两两比对距离，还对整个树的长度进行最小化，从而对树的拓扑结构进行限制。这种算法由一棵星状树开始，所有的物种都从一个中心节点出发，然后通过计算最小分支长度的和相继寻找到近邻的两个序列，每一轮过程中考虑所有可能的序列对，把能使树的整个分支长度最小的序列对一组，从而产生新的距离矩阵，直到寻找所有的近邻序列。

82、单项选择题  domain的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

83、问答题  如何查找由Rao Y 实验室于2005以后发表的，文章主题中与brain有关的文献，写出检索语言。

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本题答案：Brain[ti] AND RaoY[au] AND
本题解析：试题答案Brain[ti] AND R来源:91考试网aoY[au] AND 2005:2013[dp]

84、名词解释  CpG island

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本题答案：是DNA上的一个区域，富含GC，两者以磷酸酯键相连，长
本题解析：试题答案是DNA上的一个区域，富含GC，两者以磷酸酯键相连，长度约几百到几千bp不等，常出现在管家基因或频繁表达的基因的启动子附近，在这些部位，CpG岛具有阻止序列甲基化的作用。

85、问答题  什么是物种的标记序列？

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本题答案：指物种特有的一段核苷酸序列。可以通过相似性查询，得到某
本题解析：试题答案指物种特有的一段核苷酸序列。可以通过相似性查询，得到某一序列在数据库中的某一物种中反复出现，且在其他物种中没有的明显相似的序列。

86、名词解释  Entrez

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本题答案：是由NCBI主持的一个数据库检索系统，它包括核酸，蛋白
本题解析：试题答案是由NCBI主持的一个数据库检索系统，它包括核酸，蛋白以及Medline文摘数据库，在这三个数据库中建立了非常完善的联系。因此，可以从一个DNA序列查询到蛋白产物以及相关文献，而且，每个条目均有一个类邻（neighboring）信息，给出与查询条目接近的信息。

87、填空题  常用的序列搜索方法：（）和（）

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本题答案：FASTA；BLAST
本题解析：试题答案FASTA；BLAST

88、名词解释  BioEdit

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本题答案：BioEdit是一个序列编辑器与分析工具软件。功能包括
本题解析：试题答案BioEdit是一个序列编辑器与分析工具软件。功能包括：序列编辑、外挂分析程序、RNA分析、寻找特征序列、支持超过20000个序列的多序列文件、基本序列处理功能、质粒图绘制等等。

89、名词解释  比较基因组学

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本题答案：是在基因组图谱和测序的基础上，利用某个基因组研究获得的信息推
本题解析：试题答案是在基因组图谱和测序的基础上，利用某个基因组研究获得的信息推测其他原核生物、真核生物类群中的基因数目、位置、功能、表达机制和物种进化的学科。

90、 多项选择题  20世纪三大著名计划包括（）

A.阿波罗登月计划
B.卫星计划
C.HGP
D.肿瘤计划
E.曼哈顿原子弹计划

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本题答案：A, C, E
本题解析：暂无解析

91、填空题  检测原核生物ORF的程序：（）

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本题答案：NCBI ORF finder
本题解析：试题答案NCBI ORF finder

92、名词解释  无根树

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本题答案：只表明节点间的关系，无进化发生方向的信息，通过引入外群或外部
本题解析：试题答案只表明节点间的关系，无进化发生方向的信息，通过引入外群或外部参考物种，可以在无根树中指派根节点。

93、名词解释  先导化合物

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本题答案：是指具有一定药理活性的、可通过结构改造来优化其药理特性而可能
本题解析：试题答案是指具有一定药理活性的、可通过结构改造来优化其药理特性而可能导致药物发现的特殊化合物。就是利用计算机在含有大量化合物三维结构的数据库中，搜索能与生物大分子靶点匹配的化合物，或者搜索能与结合药效团相符的化合物，又称原型物，简称先导物，是通过各种途径或方法得到的具有生物活性的化学结构

94、名词解释  空位罚分

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本题答案：空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中
本题解析：试题答案空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中的空位的引入不代表真正的进化事件，所以要对其进行罚分，空位罚分的多少直接影响对比的结果。

95、问答题  人类基因组计划与生物信息学有什么关系？

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本题答案：人类基因组计划的实施，促进了测序技术的迅猛发展，从而使实验数
本题解析：试题答案人类基因组计划的实施，促进了测序技术的迅猛发展，从而使实验数据和可利用信息急剧增加，信息的管理和分析成为基因组计划的一项重要的工作。而这些数据信息的管理、分析、解释和使用促使了生物信息学的产生和迅速发展。

96、单项选择题  NCBI中人类无冗余基因数据库是（）。

A.UniGene
B.UniPro
C.UniRef
D.URF

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

97、问答题  如何选择合适的评分矩阵？

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本题答案：一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM
本题解析：试题答案一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM要好
当比较距离相近的蛋白时，应选择低的PAM或高的BLOSUM矩阵；当比较距离较远的蛋白时，应选择高的PAM或低的BLOSUM矩阵
对于数据库搜索来说一般选择BLOSUM62矩阵
PAM矩阵可用于寻找蛋白质的进化起源，BLOSUM矩阵用于发现蛋白质的保守域

98、多项选择题  最常用的序列相似性查询工具是（）

A.FASTA
B.BLAST
C.SWISS-PROT
D.PDB
E.PIR

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本题答案：A, B
本题解析：暂无解析

99、单项选择题  限制性片段长度多态性标记是（）。

A.RFLP
B.SNP
C.SSR
D.RAPD

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

100、问答题  在基因组序列分析方面，科学家关注哪些信息？

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本题答案：就人类基因组而言，编码区域在人类基因组所占的比例不超过
本题解析：试题答案就人类基因组而言，编码区域在人类基因组所占的比例不超过3%。其余97%是非编码序列。对于非编码序列，人们了解得比较少，尚不清楚其含义或功能。然而，非编码区域对于生命活动具有重要的意义。这部分序列主要包括内含子、简单重复序列、移动元件（mobileelement）及其遗留物、伪基因（pseudogene）等。