1、名词解释  反式调控元件

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本题答案：远离所调控的编码序列，通常位于不同的染色体上。
本题解析：试题答案远离所调控的编码序列，通常位于不同的染色体上。

2、问答题  简述DNA计算实现方式中，表面方式与试管方式相比具有哪些优点？

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本题答案：试管方式：就是在一个或多个试管的溶液里进行生化反应；<
本题解析：试题答案试管方式：就是在一个或多个试管的溶液里进行生化反应；
表面方式：是将对应的解空间的DNA分子固定在一块固体上，其次进行各种生化反应，或是在表面逐步形成解空间，然后根据具体问题对所有可能的解进行筛选，最后得到运算结果。
（1）操作简单，易于实现自动化操作；
（2）减少人为操作过程中造成的DNA分子的丢失及其它操作失误；
（3）减少分子在表面上的相互作用，同时增强分子间的特异性结合；
（4）信息储存密度大，据估计，10毫克DNA表面上的储存密度是传统计算姬的10的8次方倍，而在溶液中仅为10的5次方倍；
（5）结果易于纯化。

3、单项选择题  利用PubMed文献数据查找论文“A whole-cell computational model predicts phenotype from genotype”发表在Cell期刊的（）。

A.第50卷第1期第389-391页
B.第50卷第1期第389-401页
C.第150卷第2期第389-401页
D.第125卷第2期第389-391页

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

4、名词解释  ORF

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本题答案：核酸序列的开放阅读框，一个ORF就是一个潜在的蛋白质编
本题解析：试题答案核酸序列的开放阅读框，一个ORF就是一个潜在的蛋白质编码区。

5、问答题  你认为生物信息学有什么用？对你的生活、研究有影响吗？

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本题答案：（1）主要用于：
在基因组分析方面：生物序列相似
本题解析：试题答案（1）主要用于：
在基因组分析方面：生物序列相似性比较及其数据库搜索、基因预测、基因组进化和分子进化、蛋白质结构预测等
在医药方面：新药物设计、基因芯片疾病快速诊断、流行病学研究：SARS、人类基因组计划、基因组计划：基因芯片。
（2）指导研究和实验方案，减少操作性实验的量；验证实验结果；为实验结果提供更多的支持数据等材料。

6、问答题  简述生物类的数据库类别分为有哪两种及其定义

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本题答案：一级数据库：数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据
本题解析：试题答案一级数据库：数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释（投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白质序列提交到相应的数据库中）
二级数据库：对原始生物分子数据进行整理、分类的结果，是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定的应用目标而建立的。

7、单项选择题  RGP是（）。

A.在线人类孟德尔遗传数据
B.国家核酸数据库
C.人类基因组计划
D.水稻基因组计划

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

8、名词解释  E值

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本题答案：衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以
本题解析：试题答案衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义。

9、问答题  简述除权配对法（UPGMA）的算法思想。

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本题答案：通过两两比对聚类的方法进行，在开始时，每个序列分为一类
本题解析：试题答案通过两两比对聚类的方法进行，在开始时，每个序列分为一类，分别作为一个树枝的生长点，然后将最近的两序列合并，从而定义出一个节点，将这个过程不断的重复，直到所有的序列都被加入，最后得到一棵进化树。

10、名词解释  权重矩阵

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本题答案：基础上针对特定的应用目标而建立的数据库。
本题解析：试题答案基础上针对特定的应用目标而建立的数据库。

11、名词解释  SWLSS—MODE

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本题答案：是目前最著名的蛋白质三级结构预测服务器，建立在已知生物大分子
本题解析：试题答案是目前最著名的蛋白质三级结构预测服务器，建立在已知生物大分子结构基础上，利用同源建模的方法对未知序列的蛋白质三级结构进行预测。

12、问答题  TSS，外显子和内含子的概念。

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本题答案：TSS是转录起始位点（Transcription St
本题解析：试题答案TSS是转录起始位点（Transcription Start Site）的英文缩写，是指DNA上一段与RNA聚合酶结合并起始转录的一段DNA序列。真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。其中的编码区即为外显子，非编码区即为内含子。

13、单项选择题  DDBJ的含义是（）。

A.美国国家生物信息中心
B.欧洲分子生物学实验室
C.日本DNA数据库
D.中国基因组研究中心

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

14、问答题  假设你得到一段未知蛋白氨基酸序列，从你学习到的生物信息学分析方法和软件，设计一个分析流程来分析该未知蛋白质的功能和家族类别以及其结构预测.

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本题答案：1、用该序列进行BLASTP搜索。
2、再对
本题解析：试题答案1、用该序列进行BLASTP搜索。
2、再对其进行蛋白质结构域、功能域的搜索，可以用Znterproscan、Pfam，并对其进行结构分析。
3、再用ClustW进行多序列比对。
4、用人工神经网络的方法对其结构进行结构预测

15、名词解释  BLAST

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本题答案：基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行
本题解析：试题答案基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列 做相似性比较。

16、问答题  生物信息学在基因芯片中的应用有哪些？

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本题答案：（1）确定芯片检测目标。
（2）芯片设计。<
本题解析：试题答案（1）确定芯片检测目标。
（2）芯片设计。
（3）实验数据管理与分析。

17、填空题  测试基因预测程序正确预测基因的能力的项目是（）（基因预测评估项目）

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本题答案：GASP
本题解析：试题答案GASP

18、问答题  简述GenBank数据库中GBFF格式的结构？

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本题答案：GenBank flatfile（GBFF）是GenB
本题解析：试题答案GenBank flatfile（GBFF）是GenBank数据库的基本信息单位，也是最广泛地用以表示生物序列的格式之一。GBFF可以分成三个部分，头部包含关于整个记录的信息（描述符）；第二部分包含了注释这一记录的特性；第三部分是核苷酸序列自身。所有的核苷酸数据库记录（DDBJ/EMBL/GenBank）都在最后一行以//结尾.

19、问答题  假设你得到一段未知蛋白的氨基酸序列，从你学习到的生物信息学分析方法和软件，设计一个分析流程来分析该未知蛋白的功能和家族类别以及其结构预测。

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本题答案：1、用该序列进行BLASTP搜索。
2、再对
本题解析：试题答案1、用该序列进行BLASTP搜索。
2、再对其进行蛋白质结构域、功能域的搜索，可以用Znterproscan、Pfam，并对其进行结构分析。
3、再用ClustW进行多序列比对。
4、用人工神经网络的方法对其结构进行结构预测。

20、名词解释  虚拟细胞

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本题答案：一种建模手段，把细胞定义为许多结构，分子，反应和物质流
本题解析：试题答案一种建模手段，把细胞定义为许多结构，分子，反应和物质流的集合体。

21、问答题  什么是动态规划算法？

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本题答案：动态规划算法（Dynamic Programming
本题解析：试题答案动态规划算法（Dynamic Programming Algorithm）是一种计算方法，它的主要思路是把一个问题分成若干个小问题来解决，在序列比对尤其是双序列比对中非常重要，因为其提供了序列间最优的对位排列。在生物学中应用的两种动态规划算法：Needleman-Wunsch算法（全局比对）和Smith-Waterman算法（局部比对）。

22、单项选择题  TAIR（AtDB）数据库是（）。

A.线虫基因组
B.果蝇基因组
C.拟南芥数据库
D.大肠杆菌基因组

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

23、单项选择题  如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用（）。

A.NDB数据库
B.PDB数据库
C.GenBank数据库
D.SWISS-PROT数据库

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

24、名词解释  ESI电喷雾离子化

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本题答案：一种适合大分子如蛋白质离子化没有明显降解的质谱技术。<
本题解析：试题答案一种适合大分子如蛋白质离子化没有明显降解的质谱技术。

25、单项选择题 &nb sp;生物芯片分析中使用的聚类分析输出图形主要以下列哪种方式表现？（）

A.以彩色小方块阵列表示
B.以蜂窝形状表示
C.以黑白圆点表示
D.以彩色线条表示

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

26、填空题  蛋白质结构域家族的数据库有：（），（）

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本题答案：Pfam；SMART
本题解析：试题答案Pfam；SMART

27、填空题  高分值局部联配的BLAST参数是（）（高分值片段对），（）（期望值）

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本题答案：HSPs；E
本题解析：试题答案HSPs；E

28、名词解释  GenBank

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本题答案：是美国全国卫生研究所维护的基因序列数据库，汇集并注释了
本题解析：试题答案是美国全国卫生研究所维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸序列，与日本的DNA数据库DDBJ以及欧洲分子实验室核酸序列数据库EMBL一起，都是国际核苷酸序列数据库合作的成员。

29、名词解释  旁系同源（paralogous）

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本题答案：是通过类似基因复制的机制产生的同源序列。
本题解析：试题答案是通过类似基因复制的机制产生的同源序列。

30、填空题  常用系统发育分析软件：（）

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本题答案：PHYLIP
本题解析：试题答案PHYLIP

31、问答题  生物信息学主要研究内容。

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本题答案：（1）生物分子数据的收集与管理；
（2）数据库搜
本题解析：试题答案（1）生物分子数据的收集与管理；
（2）数据库搜索及序列比较；
（3）基因组序列分析；
（4）基因表达数据的分析与处理；
（5）蛋白质结构预测。

32、名词解释  Entrez

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本题答案：是由NCBI主持的一个数据库检索系统，它包括核酸，蛋白
本题解析：试题答案是由NCBI主持的一个数据库检索系统，它包括核酸，蛋白以及Medline文摘数据库，在这三个数据库中建立了非常完善的联系。因此，可以从一个DNA序列查询到蛋白产物以及相关文献，而且，每个条目均有一个类邻（neighboring）信息，给出与查询条目接近的信息。

33、名词解释  序列的比对

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本题答案：是一种关于序列相似性的定性描述：在什么区域相似，在什么
本题解析：试题答案是一种关于序列相似性的定性描述：在什么区域相似，在什么区域存在差别。最优比对：揭示两条序列的最大相似程度。（又叫序列联配，其意义在于从核酸、氨基酸的层次分析序列的相似性，推测其结构功能及进化上的联系，是基因识别、分子进化、生命起源研究的基础。

34、名词解释  开放阅读框（ORF）

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本题答案：开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱
本题解析：试题答案开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列。

35、单项选择题  domain的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

36、名词解释  多序列比对（multiple sequence alignment）

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本题答案：三个或多个序列之间的比对，如果序列在同一列有相同结构位
本题解析：试题答案三个或多个序列之间的比对，如果序列在同一列有相同结构位置的残基和（或）祖传的残基，则会在该位置插入空位。

37、名词解释  GenPept

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本题答案：是由GenBank中的DNA序列翻译得到的蛋白质序列。
本题解析：试题答案是由GenBank中的DNA序列翻译得到的蛋白质序列。数据量很大，且随核酸序列数据库的更新而更新，但它们均是由核酸序列翻译得到的序列，未经试验证实，也没有详细的注释。

38、名词解释  相似性

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本题答案：是可以量化的参数，是一种直接的数量关系，是量的判断，可
本题解析：试题答案是可以量化的参数，是一种直接的数量关系，是量的判断，可多可少，如百分之几。

39、名词解释  系统发育分析

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本题答案：通过一组相关的基因或者蛋白质的多序列比对或其他性状，可
本题解析：试题答案通过一组相关的基因或者蛋白质的多序列比对或其他性状，可以研究推断不同物种或基因之间的进化关系。

40、问答题  什么事件大大促进了生物信息学的发展？

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本题答案：20世纪90年代后
HGP促进生物信息学的迅
本题解析：试题答案20世纪90年代后
HGP促进生物信息学的迅速发展

41、多项选择题  下面序列哪些为反向重复序列（）

A.…GCACTTG…GCACTTG…
B.…GCACTTGCAAGTGC…；…CGTGAAC…CGTGAAC…；…CGTGAACGTTCACG…
C.…GCACTTG…CAAGTGC…
D.…GCACTAGCTAGCGG…；…CGTGAAC…GTTCACG…；…CGTGATCGATCGCC…

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本题答案：B, D
本题解析：暂无解析

42、单项选择题  GenBank数据库的基本信息单位是（）。

A.FASTA
B.GBFF
C.GCG
D.ASN.1

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

43、单项选择题  basepair的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

44、名词解释  分子钟（molecular clock）

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本题答案：对于每一个给定基因（或蛋白质）其分子进化率大致是恒定的
本题解析：试题答案对于每一个给定基因（或蛋白质）其分子进化率大致是恒定的。

45、名词解释  单基因回路

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本题答案：蛋白质与DNA启动子和增强子的相互作用。
本题解析：试题答案蛋白质与DNA启动子和增强子的相互作用。

46、名词解释  一致序列

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本题答案：这些序列是指把多序列联配的信息压缩至单条序列，主要的缺
本题解析：试题答案这些序列是指把多序列联配的信息压缩至单条序列，主要的缺点是除了在特定位置最常见的残基 之外，它们不能表示任何概率信息。

47、单项选择题  蛋白质信号肽的预测工具有（）。

A.nnpredict
B.PredictProtein
C.SingalD
D.SingalP

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

48、单项选择题  蛋白质基序（motif）中[ST]的含义是（）。

A.氨基酸为ST
B.氨基酸为S和T
C.氨基酸为S或T
D.除掉S和T之外的任意氨基酸

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

49、单项选择题  基本局部比对搜素工具是（）。

A.Mega
B.ClustalW
C.BLAST
D.GCG

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

50、问答题  假设你得到一段未知基因的DNA序列，从你学习到的生物信息学分析方法和软件，设计一个分析流程来分析该未知基因的功能和家族类别（包括系统发育树构建）

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本题答案：1、得到未知基因的DNA序列，用Blast做序列比对，找出与
本题解析：试题答案1、得到未知基因的DNA序列，用Blast做序列比对，找出与其基因相似的核苷酸序列和蛋白质序列。
2、接着，用搜索出来的较相似的序列用ClustW进行多序列比对，得到该序列的保守情况和突变情况。
3、最后用距离法构建系统发育树。

51、单项选择题  ortholog的含义是（）。

A.直系同源
B.旁系同源
C.直接进化
D.间接进化

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

52、单项选择题  利用中国知网文献数据库（中国知网）查找论文题目是“黄瓜对不同温度逆境的抗性研究”作者的单位是（）。

A.天津市黄瓜研究所
B.中国农业科学院
C.中国科学院
D.中国农业大学

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

53、问答题  以下软件的主要用途是什么？

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本题答案：RepeatMasker, CpGPlot, Spli
本题解析：试题答案RepeatMasker, CpGPlot, Splice View, Genscan, ORF finder, neural network promoter prediction.
答：RepeatMasker：是对重复序列进行分析的软件
GpGPlot：用来查找一条DNA序列中CpG岛，使用Gardine-Garden和Frommer描述的方法
Splice View：是对一段序列进行剪接位点的分析即其中的受体和供体位点
Genscan：是一种从头分析工具
ORF finder：是用来分析序列ORF的工具
neural networkpromoter prediction：神经网络启动子预测是另外一种分析启动子的方法

54、单项选择题  mRNA5′端有（）结构。

A.帽子
B.尾巴
C.帽子和尾巴
D.多聚核苷酸

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

55、问答题  预测蛋白质三级结构的三种方法

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本题答案：1）同源建模法：依据蛋白质与已知结构蛋白比对信息构建3
本题解析：试题答案1）同源建模法：依据蛋白质与已知结构蛋白比对信息构建3D模型；
2）折叠识别法：寻找与未知蛋白最合适的模板，进行序列与结构比对，最终建立结构模型；
3）从头预测法：根据序列本身从头预测蛋白质结构。

56、名词解释  genbank序列格式

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本题答案：是GenBank数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学
本题解析：试题答案是GenBank数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释；第三部分是引文区，提供了这个记录的科学依据；第四部分是核苷酸序列本身，以“//”结尾。

57、名词解释  基因预测（geneprediction）

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本题答案：用计算机程序对可能的基因所做的预测，它是基于DNA片段
本题解析：试题答案用计算机程序对可能的基因所做的预测，它是基于DNA片段与已知基因序列的匹配程度的。

58、填空题  二级结构的三种状态：（），（）和（）

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本题答案：α螺旋；β折叠；β转角
本题解析：试题答案α螺旋；β折叠；β转角

59、名词解释  FASTA序列格式

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本题答案：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨
本题解析：试题答案是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（>）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。

60、名词解释  非标度树

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本题答案：只表示亲缘关系无差异程度信息。
本题解析：试题答案只表示亲缘关系无差异程度信息。

61、单项选择题  限制性片段长度多态性标记是（）。

A.RFLP
B.SNP
C.SSR
D.RAPD

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

62、名词解释  分子进化树（molecular evolutionary tree）

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本题答案：在研究生物进化和系统分类中，常用一种类似树状分支的图形
本题解析：试题答案在研究生物进化和系统分类中，常用一种类似树状分支的图形来概括各种（类）生物之间的亲缘关系，这种树状分支的图形成为系统发育树（phylogenetictree）。

63、单项选择题  在真核生物的一个基因内含子两端，即外显子/内含子拼接边界处，其符合（）规则。

A.Kozak
B.AU…AG
C.SD
D.Poly（A）n

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

64、问答题  预测蛋白质三级结构的三种方法

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本题答案：1）同源建模法：依据蛋白质与已知结构蛋白比对信息构建3
本题解析：试题答案1）同源建模法：依据蛋白质与已知结构蛋白比对信息构建3D模型；
2）折叠识别法：寻找与未知蛋白最合适的模板，进行序列与结构比对，最终建立结构模型；
3）从头预测法：根据序列本身从头预测蛋白质结构。

65、名词解释  蛋白质组（proteome）

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本题答案：是指一个基因组、一种生物或一个细胞/组织的基因组所表达的全套
本题解析：试题答案是指一个基因组、一种生物或一个细胞/组织的基因组所表达的全套蛋白质。

66、单项选择题  PDB是蛋白质的（）。

A.分类数据库
B.结构数据库
C.模体数据库
D.结构域数据库

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

67、填空题  识别基因主要有两个途径即（）和（）。

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本题答案：基因组DNA外显子识别；基于EST策略的基因鉴定
本题解析：试题答案基因组DNA外显子识别；基于EST策略的基因鉴定

68、多项选择题  最常用的序列相似性查询工具是（）

A.FASTA
B.BLAST
C.SWISS-PROT
D.PDB
E.PIR

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本题答案：A, B
本题解析：暂无解析

69、问答题  生物信息学的发展经历了哪几个阶段

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本题答案：生物信息学的发展经历了3个阶段。
第一个阶段
本题解析：试题答案生物信息学的发展经历了3个阶段。
第一个阶段是前基因组时代。这一阶段主要是以各种算法法则的建立、生物数据库的建立以及DNA和蛋白质序列分析为主要工作；
第二阶段是基因组时代。这一阶段以各种基因组计划测序、网络数据库系统的建立和基因寻找为主要工作。
第三阶段是后基因组时代。这一阶段的主要工作是进行大规模基因组分析、蛋白质组分析以及其他各种基因组学研究。

70、问答题  简述常用的引物设计软件的名称和各自特点。

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本题答案：首先是引物分析评论功能，该功能只有少数商业版软件能够做
本题解析：试题答案首先是引物分析评论功能，该功能只有少数商业版软件能够做到，其中以“Oligo6”最优秀；其次是引物的自动搜索功能，各种软件在这方面的侧重点不同，因此自动搜索的结果也不尽相同。自动搜索功能以“PremierPrimer”为最强且方便实用，“Oligo6”其次，其他软件如“VectorNTISuit”、“Dnasis”、“Omiga”和“Dnastar”都带有引物自动搜索功能，但搜索结果不是十分理想。要想得到效果很好的引物，在自动搜索的基础上还要辅以人工分析。

71、名词解释  最大似然法（ML）

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本题答案：它对每个可能的进化位点分配一个概率，然后综合所有位点，找到概
本题解析：试题答案它对每个可能的进化位点分配一个概率，然后综合所有位点，找到概率最大的进化树。最大似然法允许采用不同的进化模型对变异进行分析评估，并在此基础上构建系统发育树。

72、问答题  简述PCR引物设计的基本原则及其注意要点

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本题答案：原则：首先引物与模板的序列要紧密互补，其次引物与引物之间避免
本题解析：试题答案原则：首先引物与模板的序列要紧密互补，其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构，再次引物不能再模板的非等位点引发DNA聚合反应（即错配）。
注意要点：
1、引物的长度一般为15-30bp，常用的是18-27bp，但不应大于38，因为过长会导致其延伸温度大于74℃，不适合于TaqDNA聚合酶进行反应。
2、引物序列在模板内应当没有相似性较高，尤其是3’端相似性较高的序列，否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基，如GGG或CCC，也会使错误引发几率增加。
3、引物3’端的末位碱基对Taq酶的DNA合成效率有较大的影响。不同的末位碱基在错配位置导致不同的扩增效率，末位碱基为A的错配效率明显高于其他3个碱基，因此应当避免在引物的3’端使用碱基。另外，引物二聚体或发夹结构也可能导致PCR反应失败。5’端序列对PCR影响不太大，因此常用来引进修饰位点或标记物。
4、引物序列的GC含量一般为40-60%，过高或过低都不利于引发反应。上下游引物的GC含量不能相差太大。
5、引物所对应模板位置序列的Tm值在72℃左右可使复性条件最佳。Tm值的计算有很多种方法，如按公式Tm=4（G+C）+2（A+T），在Oligo软件中使用的是最邻近法（thenearestneighbormethod）。
6、G值是指DNA双链形成所需的自由能，该值反映了双链结构内部碱基对的相对稳定性。应当选用3’端G值较低（绝对值不超过9），而在5’端和中间G值相对较高的引物。引物的3’端的G值过高，容易在错配位点形成双链结构并引发DNA聚合反应。
7、引物二聚体及发夹结构的能值过高（超过4.5kcal/mol）易导致产生引物二聚体带，并且降低引物有效浓度而使PCR反应不能正常进行。
8、对引物的修饰一般是在5’端增加酶切位点，应根据下一步实验中要插入PCR产物的载体的相应序列而确定。

73、名词解释  生物信息学

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本题答案：研究大量生物数据复杂关系的学科，其特征是多学科交叉，以
本题解析：试题答案研究大量生物数据复杂关系的学科，其特征是多学科交叉，以互联网为媒介，数据库为载体。利用数学知识建立各种数学模型；利用计算机为工具对实验所得大量生物学数据进行储存、检索、处理及分析，并以生物学知识对结果进行解释。

74、名词解释  折叠识别法

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本题答案：寻找与已知蛋白最合适的模板，进行结构和序列比对，最终建
本题解析：试题答案寻找与已知蛋白最合适的模板，进行结构和序列比对，最终建立机构模型。
又称为线索化方法。（另一版本：先假设一个特定的蛋白构象，然后对这一构象进行评估的过程。）

75、单项选择题  Proteomics的含义是（）。

A.生物信息学
B.基因组学
C.蛋白质组学
D.表观遗传学

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

76、名词解释  molecular phylogenetic tree

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本题答案：分子进化树，精确地反映物种间或群体间在进化过程中发生的
本题解析：试题答案分子进化树，精确地反映物种间或群体间在进化过程中发生的极微细的遗传变异，而且借助化石提供的大分子类群的分化年代能定量地估计出物种间或群体间的分化年代。

77、名词解释  PROSITE

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本题答案：是蛋白质家族和结构域数据库，包含具有生物学意义的位点、模式、
本题解析：试题答案是蛋白质家族和结构域数据库，包含具有生物学意义的位点、模式、可帮助识别蛋白质家族的统计特征。PROSITE中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或其它蛋白质结合的区域等；PROSITE还包括根据多序列比对而构建的序列统计特征，能更敏感地发现一个序列是否具有相应的特征。

78、名词解释  PAM矩阵

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本题答案：PAM指可接受突变百分率。一个氨基酸在进化中变成另一种
本题解析：试题答案PAM指可接受突变百分率。一个氨基酸在进化中变成另一种氨基酸的可能性，通过这种可能性可以鉴定蛋白质之间的相似性，并产生蛋白质之间的比对。一个PAM单位是蛋白质序列平均发生1%的替代量需要的进化时间。

79、名词解释  支架

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本题答案：由序列重叠群拼接而成。
本题解析：试题答案由序列重叠群拼接而成。

80、名词解释  可接受点突变（PAM）

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本题答案：一个用于衡量蛋白质序列的进化突变程度的单位。
本题解析：试题答案一个用于衡量蛋白质序列的进化突变程度的单位。

81、单项选择题  mRNA3′端有（）结构。

A.帽子
B.尾巴
C.帽子和尾巴
D.多聚胞嘧啶

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

82、单项选择题  STS的含义是（）。

A.表达序列标签
B.序列标签位点
C.高通量基因组序列
D.人工合成序列

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

83、问答题  简述DNA计算机的基本原理

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本题答案：1）以编码生命信息的遗传物质—DNA序列，
本题解析：试题答案1）以编码生命信息的遗传物质—DNA序列，作为信息编码的载体，利用DNA分子的双螺旋结构和碱基互补配对的性质，将所要处理的问题映射为特定的DNA分子；
2）在生物酶的作用下，通过可控的生化反应生成问题的解空间；最后利用各种现代分子生物技术如聚合酶链反应RCR、超声波降解、亲和层析、分子纯化、电泳、磁珠分离等手段破获运算结果。
DNA计算机优点：低能耗、存储容量高、运算速度快，可真正实现并行工作。

84、名词解释  马尔可夫链

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本题答案：具有马尔可夫特性的离散状态随机过程。
本题解析：试题答案具有马尔可夫特性的离散状态随机过程。

85、多项选择题  20世纪三大著名计划包括（）

A.阿波罗登月计划
B.卫星计划
C.HGP
D.肿瘤计划
E.曼哈顿原子弹计划

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本题答案：A, C, E
本题解析：暂无解析

86、名词解释  表达序列标签（EST）

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本题答案：一种短的DNA片段，是cDNA分子的一部分，可用来鉴定基因，
本题解析：试题答案一种短的DNA片段，是cDNA分子的一部分，可用来鉴定基因，通常用于基因定位和基因图谱中。

87、名词解释  比较基因组学

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本题答案：是在基因组图谱和测序的基础上，利用某个基因组研究获得的信息推
本题解析：试题答案是在基因组图谱和测序的基础上，利用某个基因组研究获得的信息推测其他原核生物、真核生物类群中的基因数目、位置、功能、表达机制和物种进化的学科。

88、问答题  在基因组序列分析方面，科学家关注哪些信息？

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本题答案：就人类基因组而言，编码区域在人类基因组所占的比例不超过
本题解析：试题答案就人类基因组而言，编码区域在人类基因组所占的比例不超过3%。其余97%是非编码序列。对于非编码序列，人们了解得比较少，尚不清楚其含义或功能。然而，非编码区域对于生命活动具有重要的意义。这部分序列主要包括内含子、简单重复序列、移动元件（mobileelement）及其遗留物、伪基因（pseudogene）等。

89、问答题  DNA双螺旋结构模型的意义

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本题答案：（1）为合理解释遗传物质的各种功能、解释生物的遗传和变
本题解析：试题答案（1）为合理解释遗传物质的各种功能、解释生物的遗传和变异、揭示自然界色彩纷纭的生命现象奠定了理论基础；
（2）揭示了生命世界多样性和生命本质的一致性的辨正统一；
（3）现代生命科学的里程碑。

90、单项选择题  隐马尔科夫模型的代号是（）。

A.HMM
B.CDD
C.HTGS
D.GSS

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

91、单项选择题  GenBank数据库中的登录号AAR19268是（）。

A.水稻的DNA序列
B.水稻的蛋白质序列
C.人类的DNA序列
D.人类的蛋白质序列

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

92、问答题  生物信息学所用的方法和技术。

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本题答案：（1）数学统计方法；
（2）动态规划方法；<
本题解析：试题答案（1）数学统计方法；
（2）动态规划方法；
（3）机器学习与模式识别技术；
（4）数据库技术及数据挖掘；
（5）人工神经网络技术；
（6）专家系统；
（7）分子模型化技术；
（8）量子力学和分子力学计算；
（9）生物分子的计算机模拟；
（10）因特网（Internet）技术。

93、名词解释  FASTA

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本题答案：是第一个被广泛使用的数据库相似性搜索算法，这个程序通过
本题解析：试题答案是第一个被广泛使用的数据库相似性搜索算法，这个程序通过扫描序列中“词”的小配对，从而寻找最优局部比对

94、多项选择题  下列哪些分子类型属于非蛋白质编码区（）

A.内含子
B.卫星DNA
C.伪基因
D.启动子
E.增强子

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本题答案：A, B, C, D, E
本题解析：暂无解析

95、单项选择题  LCR的含义是（）。

A.编码区
B.非编码区
C.低复杂度区域
D.开放阅读框

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

96、填空题  序列比对的基本思想，是找出（）和（）的相似性，就是通过在序列中插入（）的方法使所比较的序列长度达到一致。比对的数学模型大体分为两类，分别是（）和（）。

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本题答案：检测基因；目标序列；空位；整体比对；局部比对
本题解析：试题答案检测基因；目标序列；空位；整体比对；局部比对

97、问答题  序列分析的任务和目的分别是什么？

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本题答案：任务
（1）发现序列之间的相似性；

本题解析：试题答案任务
（1）发现序列之间的相似性；
（2）辨别序列之间的差异。
目的：
（1）相似序列：相似的结构，相似的功能
（2）判别序列之间的同源性
（3）推测序列之间的进化关系

98、问答题  引物设计的基本原则有哪些，有哪些基本参数要考虑，最常用的引物设计软件是什么？

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本题答案：引物设计的基本原则：引物与模板的序列要紧密互补；引物与
本题解析：试题答案引物设计的基本原则：引物与模板的序列要紧密互补；引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构；引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应（即错配）。有如下这些基本参数要考虑：引物长度，产物长度，序列Tm值，引物与模板形成双链的内部稳定性（用？G值反映），形成引物二聚体及发夹结构的能值，在错配位点的引发效率，引物及产物的GC含量，等等。最常用的引物设计软件是：Primer Premier.

99、问答题  指出下列特殊标识符的格式？

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本题答案：①序列辨认号（GI）：一串阿拉伯数字
②Ge
本题解析：试题答案①序列辨认号（GI）：一串阿拉伯数字
②GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号：
1个字母+5个阿拉伯数字；1个字母+6个阿拉伯数字
③RefSeq序列接受号：带“-”
mRNA记录（NM*）；完整的基因组或染色体（NC*）
④PDB序列接受号：1个阿拉伯数字+3个字母

100、名词解释  Ab initio prediction

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本题答案：蛋白质三级结构预测方法—从头预测法，在既没有已知结构的同源蛋
本题解析：试题答案蛋白质三级结构预测方法—从头预测法，在既没有已知结构的同源蛋白质、也没有已知结构的远程同源蛋白质的情况下，只能采用从头预测方法，即（直接）仅仅根据序列本身来预测其结构。