1、名词解释  互补序列（complementary sequence）

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本题答案：能够与其他DNA片段根据碱基互补序列（A与T配对，G与
本题解析：试题答案能够与其他DNA片段根据碱基互补序列（A与T配对，G与C配对）形成两练结构的核苷酸序列。

2、名词解释  空位（gap）

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本题答案：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点
本题解析：试题答案在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。

3、单项选择题  algorithm的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

4、名词解释  最大似然法（ML）

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本题答案：它对每个可能的进化位点分配一个概率，然后综合所有位点，找到概
本题解析：试题答案它对每个可能的进化位点分配一个概率，然后综合所有位点，找到概率最大的进化树。最大似然法允许采用不同的进化模型对变异进行分析评估，并在此基础上构建系统发育树。

5、名词解释  直系同源（Orthologous）

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本题答案：指不同种类的同源序列，他们是在物种的形成事件中从一个祖
本题解析：试题答案指不同种类的同源序列，他们是在物种的形成事件中从一个祖先序列独立进化而成的，可能有相似功能，也可能没有。

6、问答题  如何选择合适的评分矩阵？

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本题答案：一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM
本题解析：试题答案一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM要好
当比较距离相近的蛋白时，应选择低的PAM或高的BLOSUM矩阵；当比较距离较远的蛋白时，应选择高的PAM或低的BLOSUM矩阵
对于数据库搜索来说一般选择BLOSUM62矩阵
PAM矩阵可用于寻找蛋白质的进化起源，BLOSUM矩阵用于发现蛋白质的保守域

7、名词解释  PROSITE

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本题答案：是蛋白质家族和结构域数据库，包含具有生物学意义的位点、模式、
本题解析：试题答案是蛋白质家族和结构域来源:91考试网数据库，包含具有生物学意义的位点、模式、可帮助识别蛋白质家族的统计特征。PROSITE中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或其它蛋白质结合的区域等；PROSITE还包括根据多序列比对而构建的序列统计特征，能更敏感地发现一个序列是否具有相应的特征。

8、单项选择题  OMIM是（）。

A.在线人类孟德尔遗传数据库
B.国家核酸数据库
C.人类基因组计划
D.水稻基因组计划

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

9、填空题  蛋白质组研 究的三大关键核心技术是（）、（）、（）。

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本题答案：双向凝胶电泳技术；质谱鉴定技术；计算机图像数据处理与蛋白质数
本题解析：试题答案双向凝胶电泳技术；质谱鉴定技术；计算机图像数据处理与蛋白质数据库

10、名词解释  质谱（MS）

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本题答案：是一种准确测定真空中离子的分子质量/电荷比（m/z）的
本题解析：试题答案是一种准确测定真空中离子的分子质量/电荷比（m/z）的方法，从而使分子质量的准确确定成为可能。
质谱分析的两个工具

11、单项选择题  基本局部比对搜素工具是（）。

A.Mega
B.ClustalW
C.BLAST
D.GCG

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

12、名词解释  注释（annotation）

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本题答案：对数据库中原始的DNA碱基序列添加相关信息（比如编码的
本题解析：试题答案对数据库中原始的DNA碱基序列添加相关信息（比如编码的基因，氨基酸序列等）或其他的注解。

13、单项选择题  没有直接参与完成人类基因组计划的国家是（）。

A.英国
B.中国
C.俄罗斯
D.德国

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

14、单项选择题  SAGE的含义是（）。

A.基因表达连续分析
B.聚丙烯酰胺凝胶电泳
C.基因组分析
D.双向电泳分析

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

15、单项选择题  DDBJ的含义是（）。

A.美国国家生物信息中心
B.欧洲分子生物学实验室
C.日本DNA数据库
D.中国基因组研究中心

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

16、名词解释  ESI电喷雾离子化

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本题答案：一种适合大分子如蛋白质离子化没有明显降解的质谱技术。<
本题解析：试题答案一种适合大分子如蛋白质离子化没有明显降解的质谱技术。

17、填空题  检测系统发育树可靠性的技术：（）和（）

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本题答案：bootstrapping；Jack-knifing
本题解析：试题答案bootstrapping；Jack-knifing

18、名词解释  promoter

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本题答案：启动子，是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必需的一段DNA
本题解析：试题答案启动子，是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必需的一段DNA序列。

19、问答题  生物分子数据类型有哪些？

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本题答案：DNA序列数据、蛋白质序列数据、生物分子结构数据、生物分子功
本题解析：试题答案DNA序列数据、蛋白质序列数据、生物分子结构数据、生物分子功能数据

20、填空题  （）和（）中的注释所涉及的问题是不同的

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本题答案：原核生物；真核生物基因组
本题解析：试题答案原核生物；真核生物基因组

21、问答题  DNA双螺旋结构模型的意义

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本题答案：（1）为合理解释遗传物质的各种功能、解释生物的遗传和变
本题解析：试题答案（1）为合理解释遗传物质的各种功能、解释生物的遗传和变异、揭示自然界色彩纷纭的生命现象奠定了理论基础；
（2）揭示了生命世界多样性和生命本质的一致性的辨正统一；
（3）现代生命科学的里程碑。

22、问答题  简述在蛋白质三级结构预测中同源建模法的步骤。

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本题答案：（1）搜索与目标蛋白序列相似的模板蛋白
（2
本题解析：试题答案（1）搜索与目标蛋白序列相似的模板蛋白
（2）目标序列与模板序列比对
（3）建立骨架（将模板结构叠加起来，找结构保守区域）
（4）构建目标蛋白质的侧链
（5）构建目标蛋白质的环区（从已知的环区构象中选出一最优的构象）
（6）优化模型（找出结构中异常的构象）

23、单项选择题  隐马尔科夫模型的代号是（）。

A.HMM
B.CDD
C.HTGS
D.GSS

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

24、名词解释  分子进化树（molecular evolutionary tree）

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本题答案：在研究生物进化和系统分类中，常用一种类似树状分支的图形
本题解析：试题答案在研究生物进化和系统分类中，常用一种类似树状分支的图形来概括各种（类）生物之间的亲缘关系，这种树状分支的图形成为系统发育树（phylogenetictree）。

25、名词解释  ncRNA

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本题答案：非编码RNA，是指没有编码蛋白质功能的所有RNA，它缺乏开放
本题解析：试题答案非编码RNA，是指没有编码蛋白质功能的所有RNA，它缺乏开放阅读框，常由编码蛋白质的基因反转录而来。

26、多项选择题  20世纪三大著名计划包括（）

A.阿波罗登月计划
B.卫星计划
C.HGP
D.肿瘤计划
E.曼哈顿原子弹计划

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本题答案：A, C, E
本题解析：暂无解析

27、填空题  2-DE的基本原理是根据蛋白质（）和（）不同，进行两次电泳将之分离。第一向是（），第二向是（）。

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本题答案：等电点；分子量；等电聚焦分离；SDS-PAGE分离
本题解析：试题答案等电点；分子量；等电聚焦分离；SDS-PAGE分离

28、问答题  简述人类基因组研究计划的历程。

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本题答案：通过国际合作，用15年时间（1990-2005）至少投
本题解析：试题答案通过国际合作，用15年时间（1990-2005）至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其他生物进行类似研究。
1990，人类基因组计划正式启动。
1996，完成人类基因组计划的遗传作图，启动模式生物基因组计划。
1998完成人类基因组计划的物理作图，开始人类基因组的大规模测序。Celera公司加入，与公共领域竞争启动水稻基因组计划。
1999，第五届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度。
2000，Celera公司宣布完成果蝇基因组测序，国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基因组的测序工作。
2001，人类基因组“中国卷”的绘制工作宣告完成。
2003，中、美、日、德、法、英等6国科学家宣布人类基因组序列图绘制成功，人类基因组计划的.目标全部实现。
2004，人类基因组完成图公布

29、名词解释  linux operating system

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本题答案：linux操作系统，Linux是一类Unix计算机操作
本题解析：试题答案linux操作系统，Linux是一类Unix计算机操作系统的统称。Linux操作系统也是自由软件和开放源代码发展中最著名的例子。

30、填空题  常用系统发育分析软件：（）

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本题答案：PHYLIP
本题解析：试题答案PHYLIP

31、问答题  BLAST应用有哪些？

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本题答案：BLAST应用：
1.是序列分析的基础； 本题解析：试题答案BLAST应用：
1.是序列分析的基础；
2.评价实验结果；
3.为实验提供新思路，并指导进一步实验设计；
4.是寻找和鉴定新基因的重要手段；
5.是蛋白质结构预测和分子设计的基础；
6.是研究生物进化和种属分类的基本方法。

32、问答题  TSS，外显子和内含子的概念。

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本题答案：TSS是转录起始位点（Tran scription St
本题解析：试题答案TSS是转录起始位点（Transcription Start Site）的英文缩写，是指DNA上一段与RNA聚合酶结合并起始转录的一段DNA序列。真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。其中的编码区即为外显子，非编码区即为内含子。

33、名词解释  单基因回路

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本题答案：蛋白质与DNA启动子和增强子的相互作用。
本题解析：试题答案蛋白质与DNA启动子和增强子的相互作用。

34、名词解释  MMDB(Molecular Modeling Database)

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本题答案：是（NCBI）所开发的生物信息数据库集成系统Entre
本题解析：试题答案是（NCBI）所开发的生物信息数据库集成系统Entrez的一个部分，数据库的内容包括来自于实验的生物大分子结构数据。与PDB相比，对于数据库中的每一个生物大分子结构，MMDB具有许多附加的信息，如分子的生物学功能、产生功能的机制、分子的进化历史等，还提供生物大分子三维结构模型显示、结构分析和结构比较工具。

35、单项选择题  蛋白质信号肽的预测工具有（）。

A.nnpredict
B.PredictProtein
C.SingalD
D.SingalP

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

36、问答题  试述PSI-BLAST搜索的5个步骤。

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本题答案：[1]选择待查序列（query）和蛋白质数据库；本题解析：试题答案[1]选择待查序列（query）和蛋白质数据库；
[2]PSI-BLAST构建一个多序列比对，然后创建一个序列表谱（profile）又称特定位置打分矩阵（PSSM）；
[3]PSSM被用作query搜索数据库
[4]PSI-BLAST估计统计学意义（eva lues）
[5]重复[3]和[4]，直到没有新的序列发现。

37、问答题  生物信息学步入后基因组时代后，其发展方向有哪几个方面。

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本题答案：生物信息学步入后基因组时代后，其发展方向主要有：本题解析：试题答案生物信息学步入后基因组时代后，其发展方向主要有：
①各种生物基因组测序及新基因的发现；
②单核苷酸多态性（SNP）分析；
③基因组非编码区信息结构与分析；
④比较基因组学和生物进化研究；
⑤蛋白质结构和功能的研究。

38、问答题  什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵，它们的作用是什么，一般BLAST选择使用的矩阵是什么

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本题答案：PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩
本题解析：试题答案PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵（scoring matrix）。记分矩阵中含有对齐时具体使用的数值。一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩阵供选择，若要进行突变性质的进化分析时可以使用PAM，FASTA缺省推荐BLOSUM50矩阵。
PAM矩阵（Point Accepted Mutation）基于进化的点突变模型，如果两种氨基酸替换频繁，说明自然界接受这种替换，那么这对氨基酸替换得分就高。一个PAM就是一个进化的变异单位, 即1%的氨基酸改变，但这并不意味100次PAM后，每个氨基酸都发生变化，因为其中一些位置可能会经过多次突变，甚至可能会变回到原来的氨基酸。
模块替换矩阵BLOSUM(BLOcks Substitution Matrix)首先寻找氨基酸模式，即有意义的一段氨基酸片断（如一个结构域及其相邻的两小段氨基酸序列），分别比较相同的氨基酸模式之间氨基酸的保守性（某种氨基酸对另一种氨基酸的取代数据），然后，以所有 60％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM60；以所有80％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM80。

39、名词解释  标度树（scaled tree）

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本题答案：分支长度与相邻节点对的差异程度成正比的树。
本题解析：试题答案分支长度与相邻节点对的差异程度成正比的树。

40、问答题  指出下列特殊标识符的格式？

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本题答案：①序列辨认号（GI）：一串阿拉伯数字
②Ge
本题解析：试题答案①序列辨认号（GI）：一串阿拉伯数字
②GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号：
1个字母+5个阿拉伯数字；1个字母+6个阿拉伯数字
③RefSeq序列接受号：带“-”
mRNA记录（NM*）；完整的基因组或染色体（NC*）
④PDB序列接受号：1个阿拉伯数字+3个字母

41、填空题  通过比较建模预测蛋白质结构的软件有（）（SWISS—MODEL网站）

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本题答案：SWISS-PDBVIEWER
本题解析：试题答案SWISS-PDBVIEWER

42、问答题  引物设计的基本原则有哪些，有哪些基本参数要考虑，最常用的引物设计软件是什么？

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本题答案：引物设计的基本原则：引物与模板的序列要紧密互补；引物与
本题解析：试题答案引物设计的基本原则：引物与模板的序列要紧密互补；引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构；引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应（即错配）。有如下这些基本参数要考虑：引物长度，产物长度，序列Tm值，引物与模板形成双链的内部稳定性（用？G值反映），形成引物二聚体及发夹结构的能值，在错配位点的引发效率，引物及产物的GC含量，等等。最常用的引物设计软件是：Primer Premier.

43、问答题  我国自主知识产权的主要基因组测序计划有哪些？

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本题答案：水稻（2002），家鸡（2004），家蚕（2007），
本题解析：试题答案水稻（2002），家鸡（2004），家蚕（2007），家猪（2012），大熊猫（2010）

44、问答题  生物信息学研究有什么意义？

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本题答案：（1）认识生物本质，了解生物分子信息的组织和结构，破译
本题解析：试题答案（1）认识生物本质，了解生物分子信息的组织和结构，破译基因组信息，阐明生物信息之间的关系
（2）改变生物学的研究方式
（3）改变传统研究方式，引进现代信息学方法
（4）在医学上的重要意义
为疾病的诊断和治疗提供依据
为设计新药提供依据

45、名词解释  SRS(sequence retrieva l system)

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本题答案：序列查询系统，是EBI提供的多数据库查询工具之一。有与Ent
本题解析：试题答案序列查询系统，是EBI提供的多数据库查询工具之一。有与Entrez类似的功能外，还提供了一系列的序列分析工具，可以直接进行在线序列分析处理。

46、填空题  序列比对的基本思想，是找出（）和（）的相似性，就是通过在序列中插入（）的方法使所比较的序列长度达到一致。比对的数学模型大体分为两类，分别是（）和（）。

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本题答案：检测基因；目标序列；空位；整体比对；局部比对
本题解析：试题答案检测基因；目标序列；空位；整体比对；局部比对

47、问答题  如何判断起始密码子？内含子？

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本题答案：AUG甲硫氨酸（met）
内含子（5&rsq
本题解析：试题答案AUG甲硫氨酸（met）
内含子（5’-GT……AG-3’）

48、名词解释  Gene Ontology 协会

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本题答案：编辑一组动态的、可控的基因产物不同方面性质的字汇的协会
本题解析：试题答案编辑一组动态的、可控的基因产物不同方面性质的字汇的协会。从3个方面描述基因产物的性质，即，分子功能，生物过程，细胞区室。

49、名词解释  neighbor—joining method

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本题答案：邻接法，基于最小进化原理经常被使用的一种算法，它不检验所有可
本题解析：试题答案邻接法，基于最小进化原理经常被使用的一种算法，它不检验所有可能的拓扑结构，能同时给出拓扑结构和分支长度。在重建系统发生树时，认为在进化分子上，发生趋异的次数可以不同，它是最有效的的基于距离数据重建系统树的方法之一。

50、填空题  多序列联配的常用软件：（）

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本题答案：Clustal
本题解析：试题答案Clustal

51、多项选择题  真核基因组特点包括（）

A.基因组大，巨大的非编码序列，重复序列占了绝大部分
B.基因结构复杂，无显著长度的开放阅读框
C.存在可变剪接
D.CpG岛
E.等值区

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本题答案：A, B, C, D, E
本题解析：暂无解析

52、名词解释  miRNA

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本题答案：是一类小的非编码单链RNA，由19~25个核苷酸构成，
本题解析：试题答案是一类小的非编码单链RNA，由19~25个核苷酸构成，广泛存在于动植物中，调节着基因表达。

53、名词解释  权重矩阵（序列轮廓）

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本题答案：它们表示完全结构域序列，多序列联配中每个位点的氨基酸都
本题解析：试题答案它们表示完全结构域序列，多序列联配中每个位点的氨基酸都有分值，并且特定位置插入或缺失的可能性均有一定的衡量方法（课件定义）。基础上针对特定的应用目标而建立的数据库。

54、填空题  检测原核生物ORF的程序：（）

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本题答案：NCBI ORF finder
本题解析：试题答案NCBI ORF finder

55、单项选择题  ortholog的含义是（）。

A.直系同源
B.旁系同源
C.直接进化
D.间接进化

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

56、单项选择题  利用中国知网文献数据库（中国知网）查找论文题目是“黄瓜对不同温度逆境的抗性研究”作者的单位是（）。

A.天津市黄瓜研究所
B.中国农业科学院
C.中国科学院
D.中国农业大学

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

57、问答题  什么事件大大促进了生物信息学的发展？

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本题答案：20世纪90年代后
HGP促进生物信息学的迅
本题解析：试题答案20世纪90年代后
HGP促进生物信息学的迅速发展

58、问答题  生物信息学分析的数据对象主要有哪几种？这些数据之间存在着什么关系？

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本题答案：其研究重点主要落实在核酸和蛋白质两个方面，包括它们的序
本题解析：试题答案其研究重点主要落实在核酸和蛋白质两个方面，包括它们的序列、结构和功能。生物信息学以基因组DNA序列信息分析作为出发点，破译遗传语言，认识遗传信息的组织规律，辨别隐藏在DNA序列中的基因，掌握基因调控信息，对蛋白质空间结构进行模拟和预测，依据蛋白质结构和功能的关系进行药物分子设计。

59、填空题  蛋白质结构域家族的数据库有：（），（）

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本题答案：Pfam；SMART
本题解析：试题答案Pfam；SMART

60、单项选择题  alignment的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

61、填空题  表达序列标签是从（）中生成的一些很短的序列（300-500bp），它们代表在特定组织或发育阶段表达的基因。

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本题答案：mRNA
本题解析：试题答案mRNA

62、名词解释  BLASTp

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本题答案：是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列
本题解析：试题答案是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。

63、填空题  目前由NCBI维护的大型文献资源是（）

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本题答案：PubMed
本题解析：试题答案PubMed

64、名词解释  简约信息位点

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本题答案：指基于DNA或蛋白质序列，利用最大简约法构建系统发育树
本题解析：试题答案指基于DNA或蛋白质序列，利用最大简约法构建系统发育树时，如果每个位点的状态至少存在两种，每种状态至少出现两次的位点。其它位点为都是非简约性信息位点。

65、名词解释  PDB（Protein Data Bank）

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本题答案：PDB中收录了大量通过实验（X射线晶体衍射，核磁共振N
本题解析：试题答案PDB中收录了大量通过实验（X射线晶体衍射，核磁共振NMR）测定的生物大分子的三维结构，记录有原子坐标、配基的化学结构和晶体结构的描述等。PDB数据库的访问号由一个数字和三个字母组成（如，4HHB），同时支持关键词搜索，还可以FASTA程序进行搜索。

66、问答题  给定一条序列，简述使用BLAST进行序列比对分析的策略

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本题答案：1）获得查询序列，以FASTA格式黏贴到BLAST文本
本题解析：试题答案1）获得查询序列，以FASTA格式黏贴到BLAST文本框中；
2）选择一个BLAST程序（blastp，blastn，blastx，tblastx，tblastn）；
3）选择一个用于搜索的数据库；
4）为搜索和输出格式选择可选的参数；
5）Search，结果分析。

67、名词解释  外类群

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本题答案：是进化树中处于一组被分析物种之外的，具有相近亲缘关系的
本题解析：试题答案是进化树中处于一组被分析物种之外的，具有相近亲缘关系的物种。

68、填空题  二级结构的三种状态：（），（）和（）

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本题答案：α螺旋；β折叠；β转角
本题解析：试题答案α螺旋；β折叠；β转角

69、问答题  真核基因结构识别主要包含哪些内容？

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本题答案：（1）ORF识别及其可靠性验证：确定DNA序列的编码区
本题解析：试题答案（1）ORF识别及其可靠性验证：确定DNA序列的编码区
（2）启动子及转录因子结合位点分析：CAP序列、识别区、解旋区、转录起始位点
（3）重复序列分析：哺乳动物基因组中存在大量重复序列，由于重复序列的大量存在常会影响序列的正确分析，因此在对真核基因进行分析前，最好能把重复序列找出来，并从序列中屏蔽掉
（4）CpGisland：可以为基因及其启动子的预测提供重要的线索
（5）3’UTR区：真核生物的转录终止信号是在3’UTR区

70、名词解释  CpG island

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本题答案：是DNA上的一个区域，富含GC，两者以磷酸酯键相连，长
本题解析：试题答案是DNA上的一个区域，富含GC，两者以磷酸酯键相连，长度约几百到几千bp不等，常出现在管家基因或频繁表达的基因的启动子附近，在这些部位，CpG岛具有阻止序列甲基化的作用。

71、问答题  什么是多序列全局比对的累进算法？（三个步骤）

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本题答案：第一，所有的序列之间逐一比对（双重比对）；

本题解析：试题答案第一，所有的序列之间逐一比对（双重比对）；
第二，生成一个系统树图，将序列按相似性大致分组；
第三，使用系统树图作为引导，产生出最终的多序列比对结果。

72、名词解释  序列的比对

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本题答案：是一种关于序列相似性的定性描述：在什么区域相似，在什么
本题解析：试题答案是一种关于序列相似性的定性描述：在什么区域相似，在什么区域存在差别。最优比对：揭示两条序列的最大相似程度。（又叫序列联配，其意义在于从核酸、氨基酸的层次分析序列的相似性，推测其结构功能及进化上的联系，是基因识别、分子进化、生命起源研究的基础。

73、问答题  BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途什么？

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本题答案：blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行
本题解析：试题答案blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较；Blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较，可以寻找较远的关系；Blastx将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与蛋白质数据库中的序列进行比对，对分析新序列和EST很有用；Tblastn将给定的氨基酸序列与核酸数据库中的序列（双链）按不同的阅读框进行比对，对于寻找数据库中序列没有标注的新编码区很有用；Tblastx只在特殊情况下使用，它将DNA被检索的序列和核酸序列数据库中的序列按不同的阅读框全部翻译成蛋白质序列，然后进行蛋白质序列比对。

74、问答题  序列比对分类有哪些？

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本题答案：A、双序列比对：两条序列的比对
B、多序列比
本题解析：试题答案A、双序列比对：两条序列的比对
B、多序列比对：三条或以上序列的比对

75、问答题  什么叫contig？

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本题答案：Contig：重叠群，基因组测序中将许多序列片段经过比
本题解析：试题答案Contig：重叠群，基因组测序中将许多序列片段经过比对找到重叠区，从而连接成的长片段。

76、名词解释  进化树的二歧分叉结构

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本题答案：指在进化树上任何一个分支节点，一个父分支都只能被分成两
本题解析：试题答案指在进化树上任何一个分支节点，一个父分支都只能被分成两个子分支。

77、名词解释  motif

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本题答案：又称模体，实序列中局部的保守区域，或者是一组序列中共有
本题解析：试题答案又称模体，实序列中局部的保守区域，或者是一组序列中共有的一小段序列模式。通常由2、3个二级结构单位组成，一般为α螺旋、β折叠和环。motif作为结构域中的亚单位，表现结构域的各种生物学功能。

78、名词解释  序列注释

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本题答案：是指从原始序列数据中获得有用的生物学信息。这主要是指基
本题解析：试题答案是指从原始序列数据中获得有用的生物学信息。这主要是指基因组DNA中寻找基因和其他功能元件（结构注释），并给出这些序列的功能（功能注释）。

79、单项选择题  EST的含义是（）。

A.表达序列标签
B.序列标签位点
C.高通量基因组序列
D.人工合成序列

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

80、单项选择题  STS的含义是（）。

A.表达序列标签
B.序列标签位点
C.高通量基因组序列
D.人工合成序列

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本题答案：B
本题解析：暂无解析

81、名词解释  折叠识别法

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本题答案：寻找与已知蛋白最合适的模板，进行结构和序列比对，最终建
本题解析：试题答案寻找与已知蛋白最合适的模板，进行结构和序列比对，最终建立机构模型。
又称为线索化方法。（另一版本：先假设一个特定的蛋白构象，然后对这一构象进行评估的过程。）

82、单项选择题  目前应用于基因芯片表达数据统计分析的主要方法是（）。

A.卡方检验
B.相关分析
C.聚类分析
D.正态性分布检验

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

83、名词解释  EMBL

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本题答案：EMBL实验室—欧洲分子生物学实验室，EM
本题解析：试题答案EMBL实验室—欧洲分子生物学实验室，EMBL数据库—是非盈利性学术组织EMBL建立的综合性数据库，EMBL核酸数据库是欧洲最重要的核酸序列数据库，它定期地与美国的GenBank、日本的DDBJ数据库中的数据进行交换，并同步更新。

84、名词解释  分子钟

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本题答案：认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说，从而可以通
本题解析：试题答案认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说，从而可以通过分子进化推断出物种起源的时间。

85、名词解释  MEGA(Molecular Evolutionary Genetics Analysis)

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本题答案：是一款免费的构树软件，它提供了序列比对、格式转换、数据
本题解析：试题答案是一款免费的构树软件，它提供了序列比对、格式转换、数据修订、距离计算、系统树重建和可信度评估等全套功能，能对DNA、mRNA氨基酸序列及遗传距离进行系统发生分析以及基因分化年代的分析。

86、名词解释  序列比对（alignment）

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本题答案：将两个或多个序列排在一起，以达到最大一致性的过程（对于氨基酸
本题解析：试题答案将两个或多个序列排在一起，以达到最大一致性的过程（对于氨基酸序列是比较他们的保守性），这样评估序列间的相似性和同源性。

87、名词解释  先导化合物

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本题答案：是指具有一定药理活性的、可通过结构改造来优化其药理特性而可能
本题解析：试题答案是指具有一定药理活性的、可通过结构改造来优化其药理特性而可能导致药物发现的特殊化合物。就是利用计算机在含有大量化合物三维结构的数据库中，搜索能与生物大分子靶点匹配的化合物，或者搜索能与结合药效团相符的化合物，又称原型物，简称先导物，是通过各种途径或方法得到的具有生物活性的化学结构

88、名词解释  空位罚分

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本题答案：空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中
本题解析：试题答案空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中的空位的引入不代表真正的进化事件，所以要对其进行罚分，空位罚分的多少直接影响对比的结果。

89、名词解释  E值

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本题答案：衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以
本题解析：试题答案衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义。

90、问答题  系统发育树的构建步骤是什么？

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本题答案：①多序列比对（自动比对、手工比对）
②建立取
本题解析：试题答案①多序列比对（自动比对、手工比对）
②建立取代模型（建树的方法）
③建立进化树
④进化树的评估

91、单项选择题  利用PubMed文献数据查找论文“Transgenic plants of Petunia hybrida harboring the CYP2E1 gene efficiently remove benzene and toluene pollutants and improve resistance to formaldehyde”的第一作者是（）。

A.XiangT
B.BaoL
C.LiP
D.ZhangD

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本题答案：D
本题解析：暂无解析

92、名词解释  基因预测的从头分析

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本题答案：依据综合利用基因的特征，如剪接位点，内含子与外显子边界
本题解析：试题答案依据综合利用基因的特征，如剪接位点，内含子与外显子边界，调控区，预测基因组序列中包含的基因。

93、名词解释  保守序列（conserved sequence）

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本题答案：指DNA分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中氨基酸片段，
本题解析：试题答案指DNA分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中氨基酸片段，它们在进化过程中基本保持不变。

94、单项选择题  Bioinformatics的含义是（）。

A.生物信息学
B.基因组学
C.蛋白质组学
D.表观遗传学

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

95、名词解释  Entrez检索系统

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本题答案：是NCBI开发的核心检索系统，集成了NCBI的各种数据
本题解析：试题答案是NCBI开发的核心检索系统，集成了NCBI的各种数据库，具有链接的数据库多，使用方便，能够进行交叉索引等特点。

96、名词解释  FASTA

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本题答案：是第一个被广泛使用的数据库相似性搜索算法，这个程序通过
本题解析：试题答案是第一个被广泛使用的数据库相似性搜索算法，这个程序通过扫描序列中“词”的小配对，从而寻找最优局部比对

97、名词解释  系统生物学（systems biology）

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本题答案：是研究一个生物系统中所有组分成分（基因、mRNA、蛋白
本题解析：试题答案是研究一个生物系统中所有组分成分（基因、mRNA、蛋白质等）的构成以及在特定条件下这些组分间的相互关系，并分析生物系统在一定时间内的动力学过程

98、单项选择题  在真核生物中，一个基因cDNA的5′端起始密码子AUG的前后序列符合（）规则。

A.Kozak
B.AU…AG
C.SD
D.Poly（A）n

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

99、填空题  聚类分析方法，分为有（）

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本题答案：监督学习方法，无监督学习方法
本题解析：试题答案监督学习方法，无监督学习方法

100、问答题  掌握蛋白质结构有什么意义？为什么要进行蛋白质结构预测？

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本题答案：（1）研究蛋白质的结构意义重大，分析蛋白质结构、功能及其关系
本题解析：试题答案（1）研究蛋白质的结构意义重大，分析蛋白质结构、功能及其关系是蛋白质组计划中的一个重要组成部分。研究蛋白质结构，有助于了解蛋白质的作用，了解蛋白质如何行使其生物功能，认识蛋白质与蛋白质（或其它分子）之间的相互作用，这无论是对于生物学还是对于医学和药学，都是非常重要的。
（2）对于未知功能或者新发现的蛋白质分子，通过结构分析，可以进行功能注释，指导设计进行功能确认的生物学实验。通过分析蛋白质的结构，确认功能单位或者结构域，可以为遗传操作提供目标，为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据，同时为新的药物分子设计提供合理的靶分子结构。