1、单项选择题  OMIM是（）。

A.在线人类孟德尔遗传数据库
B.国家核酸数据库
C.人类基因组计划
D.水稻基因组计划

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

2、名词解释  整体联配（global alignmen t）

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本题答案：对两个核苷酸或蛋白质序列的全长所进行的比对。
本题解析：试题答案对两个核苷酸或蛋白质序列的全长所进行的比对。

3、填空题  识别基因主要有两个途径即（）和（）。

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本题答案：基因组DNA外 显子识别；基于EST策略的基因鉴定
本题解析：试题答案基因组DNA外显子识别；基于EST策略的基因鉴定

4、单项选择题  利用PubMed文献数据查找论文“A whole-cell computational model predicts phenotype from genotype”发表在Cell期刊的（）。

A.第50卷第1期第389-391页
B.第50卷第1期第389-401页
C.第150卷第2期第389-401页
D.第125卷第2期第389-391页

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本题答案：C
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5、名词解释  PAM矩阵

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本题答案：PAM指可接受突变百分率。一个氨基酸在进化中变成另一种
本题解析：试题答案PAM指可接受突变百分率。一个氨基酸在进化中变成另一种氨基酸的可能性，通过这种可能性可以鉴定蛋白质之间的相似性，并产生蛋白质之间的比对。一个PAM单位是蛋白质序列平均发生1%的替代量需要的进化时间。

6、名词解释  maxi mum parsimony method

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本题答案：最大简约法基于进化过程中所需核苷酸（或氨基酸）替代数目
本题解析：试题答案最大简约法基于进化过程中所需核苷酸（或氨基酸）替代数目最少的假说，对所有可能正确的拓扑结构进行计算并挑选出所需替代数最小的拓扑结构作为最优系统树。

7、名词解释  非信息位点

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本题答案：对于最大简约法来说没有意义的点。
本题解析：试题答案对于最大简约法来说没有意义的点。

8、单项选择题  利用中国知网文献数据库（中国知网）查找论文题目是“扩张蛋白家族蛋白序列分析”发表在期刊“生物信息学”2008年第7卷第3期上（）。

A.第3-5页
B.第93-95页
C.第193-195页
D.第293-295页

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本题答案：C
本题解析：暂无解析

9、名词解释  DDBJ

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本题答案：日本DNA数据库，主要向研究者收集DNA序列信息并赋予
本题解析：试题答案日本DNA数据库，主要向研究者收集DNA序列信息并赋予其数据存取号，信息来源主要是日本的研究机构，也接受其他国家呈递的序列。

10、问答题  什么是动态规划算法？

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本题答案：动态规划算法（Dynamic Programming
本题解析：试题答案动态规划算法（Dynamic Programming Algorithm）是一种计算方法，它的主要思路是把一个问题分成若干个小问题来解决，在序列比对尤其是双序列比对中非常重要，因为其提供了序列间最优的对位排列。在生物学中应用的两种动态规划算法：Needleman-Wunsch算法（全局比对）和Smith-Waterman算法（局部比对）。

11、名词解释  structure domain

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本题答案：结构域，是在蛋白质三级结构中介于二级和三级结构之间的可
本题解析：试题答案结构域，是在蛋白质三级结构中介于二级和三级结构之间的可以明显区分但又相对独立的折叠单元，每个结构域自身形成紧实的三维结构，可以独立存在或折叠，但结构域与结构域之间关系较为松散。

12、名词解释  直系同源

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本题答案：指由于物种形成事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序
本题解析：试题答案指由于物种形成事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，具有相似或不同的功能。（书：在缺乏任何基因复制证据的情况下，具有共同祖先和相同功能的同源基因。）

13、名词解释  权重矩阵（序列轮廓）

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本题答案：它们表示完全结构域序列 ，多序列联配中每个位点的氨基酸都
本题解析：试题答案它们表示完全结构域序列，多序列联配中每个位点的氨基酸都有分值，并且特定位置插入或缺失的可能性均有一定的衡量方法（课件定义）。基础上针对特定的应用目标而建立的数据库。

14、单项选择题  限制性片段长度多态性标记是（）。

A.RFLP
B.SNP
C.SSR
D.RAPD

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本题答案：A
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15、问答题  简述GenBank数据库中GBFF格式的结构？

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本题答案：GenBank flatfile（GBFF）是GenB
本题解析：试题答案GenBank flatfile（GBFF）是GenBank数据库的基本信息单位，也是最广泛地用以表示生物序列的格式之一。GBFF可以分成三个部分，头部包含关于整个记录的信息（描述符）；第二部分包含了注释这一记录的特性；第三部分是核苷酸序列自身。所有的核苷酸数据库记录（DDBJ/EMBL/GenBank）都在最后一行以//结尾.

16、问答题  指出下列特殊标识符的格式？

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本题答案：①序列辨认号（GI）：一串阿拉伯数字
②Ge
本题解析：试题答案①序列辨认号（GI）：一串阿拉伯数字
②GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号：
1个字母+5个阿拉伯数字；1个字母+6个阿拉伯数字
③RefSeq序列接受号：带“-”
mRNA记录（NM*）；完整的基因组或染色体（NC*）
④PDB序列接受号：1个阿拉伯数字+3个字母

17、问答题  简述最大似然法（ML）的算法思想。

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本题答案：是一种基于离散特征的进化树算法。该法首先选择一个合适的进化模
本题解析：试题答案是一种基于离散特征的进化树算法。该法首先选择一个合适的进化模型，然后对所有可能的进化树进行评估，通过对每个进化位点的替代分配一个概率，最后找出概率最大的进化树。

18、名词解释  权重矩阵

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本题答案：基础上针对特定的应用目标而建立的数据库。
本题解析：试题答案基础上针对特定的应用目标而建立的数据库。

19、名词解释  E值

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本题答案：衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以
本 题解析：试题答案衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义。

20、单项选择题  Blast结果中HSP的含义是（）。

A.空位
B.期望值
C.过滤
D.高分配对片段

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本题答案：D
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21、问答题  HGP选择作为研究人类的四大“模式生物“有哪些？

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本题答案：酵母、线虫、果蝇、小鼠。
本题解析：试题答案酵母、线虫、果蝇、小鼠。

22、问答题  为什么蛋白质空间结构预测很重要，目前有哪几条途径用于从蛋白质的氨基酸序列预测其空间三维结构？

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本题答案：蛋白质空间结构的预测很重要。研究蛋白质结构，有助于了解
本题解析：试题答案蛋白质空间结构的预测很重要。研究蛋白质结构，有助于了解蛋白质如何行使其生物功能，认识蛋白质与蛋白质（或其它分子）之间的相互作用，通过分析蛋白质的结构，确认功能单位或者结构域，可以为遗传操作提供目标，为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据，同时为新的药物分子设计提供合理的靶分子结构。
目前有三条途径用于从蛋白质一级序列预测其空间三维结构：
A、同源建模法。是蛋白质三维结构预测的主要方法。对于一个未知结构的蛋白质，首先通过序列同源分析找到一个已知结构的同源蛋白质，然后，以该蛋白质的结构为模板，为未知结构的蛋白质建立结构模型。前提是必须要有一个已知结构的同源蛋白质。
B、穿针引线法。需建立核心折叠数据库，在预测蛋白质空间结构时将一个待预测结构的蛋白质序列与数据库中核心折叠进行比对，找出比对结果最好的核心折叠，作为构造待预测蛋白质结构模型的根据。
C、从头开始法。在既没有已知结构的同源蛋白质、也没有已知结构的远程同源蛋白质的情况下，直接根据序列本身来预测其结构。该方法先对蛋白质及溶剂作近似处理，再建立能量函数，通过对构象空间进行快速搜索找到与某一全局最小能量相对应的构象。

23、问答题  生物信息学的目标和任务？

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本题答案：收集和管理生物分子数据；数据分析和挖掘；开发分析工具和
本题解析：试题答案收集和管理生物分子数据；数据分析和挖掘；开发分析工具和实用软件：生物分子序列比较工具、基因识别工具、生物分子结构预测工具、基因表达数据分析工具。

24、单项选择题  ORF的含义是（）。

A.调控区
B.非编码区
C.低复杂度区域
D.开放阅读框

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本题答案：D
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25、问答题  TrEMBL哪两个部分？

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本题答案：（1）SP-TrEMBL（SWISS-PROTTrEM
本题解析：试题答案（1）SP-TrEMBL（SWISS-PROTTrEMBL）
包含最终将要集成到SWISS-PROT的数据，所有的SP-TrEMBL序列都已被赋予SWISS-PROT的登录号。
（2）REM-TrEMBL（REMainingTrEMBL）
包括所有不准备放入SWISS-PROT的数据，因此这部分数据都没有登录号。

26、单项选择题  生物信息学主要是利用哪种工具实现对生命科学研究中生物信息的 存储、检索和分析的？（）

A.计算机
B.iPhone
C.人造卫星
D.手机

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本题答案：A
本题解析：暂无解析

27、单项选择题  domain的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域

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本题答案：D
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28、单项选择题  GenBank数据库的基本信息单位是（）。

A.FASTA
B.GBFF
C.GCG
D.ASN.1

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本题答案：B
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29、问答题  TSS，外显子和内含子的概念。

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本题答案：TSS是转录起始位点（Transcription St
本题解析：试题答案TSS是转录起始位点（Transcription Start Site）的英文缩写，是指DNA上一段与RNA聚合酶结合并起始转录的一段DNA序列。真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。其中的编码区即为外显子，非编码区即为内含子。

30、名词解释  支架

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本题答案：由序列重叠群拼接而成。
本题解析：试题答案由序列重叠群拼接而成。