新疆自治区内共有11所院校参与排名，其中排名第一的是新疆大学，排名第二的是石河子大学，排名第三的是新疆农业大学，以下是2016年新疆自治区大学排名表单，供大家参考！

　　1、新疆大学——综合

　　2、石河子大学——综合

　　3、新疆农业大学——农林

　　4、新疆医科大学——医药

　　5、新疆师范大学——师范

　　6、塔里木大学——综合

　　7、新疆财经大学——财经

　　8、伊犁师范学院——师范

　　9、喀什大学——师范

　　10、昌吉学院——师范

　　11、新疆工程学院——理工