2016年12月，根据国家和地方对先进科技与高端专业人才的迫切需求，服务“一带一路”倡议、海洋强国和粤港澳大湾区建设等重大战略需求，促进文理医工融合发展，中山大学成立土木工程学院，复办土木工程学科，聘请中国工程院院士王复明教授担任首任院长。2018年7月，在学校“双一流”建设与工科发展规划指引下，水利工程学科调整至土木工程学院建设。

土木工程学院坐落在毗邻港澳、依山傍海的中山大学珠海校区。珠海校区是中山大学“三校区五校园”的重要组成部分，自2000开始培养第一批本科生，迄今拥有20个整建制院系。

经广泛深入调研和两次专家论证，学院确定了发展定位和建设目标：面向国家基础设施可持续发展、新型城镇化、海洋开发、生态文明建设等重大战略需求，将土木与水利、交通、海洋工程等学科融合发展，以“水土交融”为特色，以水—土（岩）—结构耦合体系的灾变防控共性关键问题为主线，重点发展基础设施运维、地下空间工程、海洋土木工程、城市水务、水资源水生态、河海动力过程6个学科方向，努力建设中国特色世界一流的“大土木”工程学科，培养德才兼备、具有领袖气质和家国情怀的宽口径、厚基础、复合型高级专门人才。

学院以人才强校战略为指引，秉持“发展是第一要务，人才是第一资源，创新是第一动力”的理念，大力引进海内外优秀人才，已形成多元化、国际化、高水平师资队伍，包括中国工程院院士1位，国家重大科学研究项目首席科学家1位，国家优秀青年科学基金获得者1位，广东省“珠江人才计划”引进创 新创业团队2个等。

学院已建立起本硕博完整的人才培养体系，设有土木工程和水利工程一级学科硕士点、博士点，2020年获批开设“土木、水利与海洋工程”本科新专业。学院现有本硕博学生800余人，人才培养规模稳步扩大。学院正在积极推动“土木工程学科群实践育人共享平台”建设。

学院积极参与南方海洋科学与工程广东省实验室（珠海）、先进能源科学与技术广东省实验室（阳江海上风电分中心）的建设。学院将充分利用坝道工程医院（全国各地有50余家分院）、广东省海洋土木工程重点实验室、广东省地下空间开发工程技术研究中心、广东省重大基础设施安全工程技术研究中心、广东省华南地区水安全调控工程技术研究中心、中山大学河南研究院等平台开展科学研究和人才培养工作。​

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