农业部南京农业机械化研究所的建所历史可追溯到1934年中央农业实验所植物病虫害系与中央棉产改进所合作成立的病虫机械实验室的建立。1957年10月，经国务院、原农林部批准，农业部南京农业机械化研究所正式成立。我所地处古城南京钟山风景区南麓，现有在职职工252人，其中研究员21人、副研究员（含高级工程师、副编审等）59人。经过几十年的建设，现已形成耕种机械、收获机械、农产品加工机械、植保及资源化利用机械等4个研究领域及11个研究方向，共获得各类科研成果1400多项，其中国家、部、省级科技奖励150多项，国家发明和实用新型专利200多项。在农业部组织全国1077个农业科研机构参加的“十一五”综合能力评估中，我所在农牧渔业设施装备与工程专业位列第1名，在农机行业位列第1名，2013年7月进入中国农业科学院第一批科技创新工程试点单位，是农业工程科研领域国家级研究所。

我所建成了国家级博士后科研工作站、农业部农业机械重点开放实验室、中国农业科学院农业工程技术中心、中国农科院农业机械重点实验室、江苏省农作物收获装备工程技术中心、中国农业科学院南京农业机械野外科学观测试验站、南京市农业机械工程技术研究中心等科研平台，依托我所建设的农业部现代农业装备综合性重点实验室已获批建设。加入了生物燃气、麻产业等科技创新战略联盟，拥有国家现代农业产业技术体系油菜、花生2个机械功能研究室和7名岗位专家。

除科研平台外，我所还设有国家植保机械质量监督检验中心、全所农机化教育培训中心、农业部植保与清洗机械质量监督检验测试中心、机械工业耕作机械产品质量检测中心、农业部南方种子加工工程技术中心、农业部南京设计院等单位。主办中文核心《中国农机化》和《农业开发与装备》杂志，编辑出版我国大型工具书《中国农业机械化年鉴》。

我所中长期发展目标：以科学研究为根本，以产业开发为动力，以社会服务为依托，以管理创新为抓手，坚持科学研究、产业开发和服务社会三位一体，优化结构，拓宽领域，立足江苏，面向全国，经过努力，逐步把南京农业机械化研究所建成国家农业工程技术创新中心、国际农业工程技术合作与交流中心、南方农业工程技术产业孵化中心和国家农业工程技术人才培训中心。

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